Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWQ7

Spcs3, Signal peptidase complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spcs3Q6ZWQ7 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Spcs3Q6ZWQ7 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Spcs3Q6ZWQ7 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Spcs3Q6ZWQ7 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Spcs3Q6ZWQ7 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Spcs3Q6ZWQ7 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Spcs3Q6ZWQ7 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Spcs3Q6ZWQ7 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Spcs3Q6ZWQ7 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Spcs3Q6ZWQ7 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Spcs3Q6ZWQ7 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Spcs3Q6ZWQ7 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Spcs3Q6ZWQ7 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Spcs3Q6ZWQ7 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Spcs3Q6ZWQ7 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Spcs3Q6ZWQ7 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Spcs3Q6ZWQ7 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Spcs3Q6ZWQ7 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Spcs3Q6ZWQ7 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Spcs3Q6ZWQ7 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Spcs3Q6ZWQ7 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Spcs3Q6ZWQ7 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Spcs3Q6ZWQ7 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Spcs3Q6ZWQ7 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Spcs3Q6ZWQ7 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Spcs3Q6ZWQ7 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Spcs3Q6ZWQ7 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Spcs3Q6ZWQ7 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Spcs3Q6ZWQ7 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Spcs3Q6ZWQ7 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Spcs3Q6ZWQ7 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Spcs3Q6ZWQ7 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Spcs3Q6ZWQ7 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Spcs3Q6ZWQ7 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Spcs3Q6ZWQ7 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Spcs3Q6ZWQ7 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Spcs3Q6ZWQ7 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Spcs3Q6ZWQ7 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Spcs3Q6ZWQ7 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Spcs3Q6ZWQ7 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Spcs3Q6ZWQ7 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Spcs3Q6ZWQ7 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Spcs3Q6ZWQ7 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Spcs3Q6ZWQ7 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Spcs3Q6ZWQ7 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Spcs3Q6ZWQ7 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Spcs3Q6ZWQ7 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Spcs3Q6ZWQ7 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Spcs3Q6ZWQ7 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Spcs3Q6ZWQ7 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Spcs3Q6ZWQ7 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Spcs3Q6ZWQ7 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Spcs3Q6ZWQ7 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Spcs3Q6ZWQ7 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Spcs3Q6ZWQ7 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Spcs3Q6ZWQ7 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Spcs3Q6ZWQ7 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Spcs3Q6ZWQ7 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Spcs3Q6ZWQ7 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Spcs3Q6ZWQ7 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Spcs3Q6ZWQ7 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Spcs3Q6ZWQ7 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Spcs3Q6ZWQ7 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Spcs3Q6ZWQ7 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Spcs3Q6ZWQ7 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Spcs3Q6ZWQ7 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Spcs3Q6ZWQ7 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Spcs3Q6ZWQ7 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Spcs3Q6ZWQ7 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Spcs3Q6ZWQ7 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Spcs3Q6ZWQ7 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Spcs3Q6ZWQ7 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Spcs3Q6ZWQ7 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Spcs3Q6ZWQ7 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Spcs3Q6ZWQ7 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Spcs3Q6ZWQ7 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Spcs3Q6ZWQ7 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Spcs3Q6ZWQ7 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Spcs3Q6ZWQ7 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Spcs3Q6ZWQ7 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Spcs3Q6ZWQ7 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Spcs3Q6ZWQ7 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Spcs3Q6ZWQ7 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Spcs3Q6ZWQ7 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Spcs3Q6ZWQ7 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Spcs3Q6ZWQ7 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Spcs3Q6ZWQ7 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Spcs3Q6ZWQ7 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Spcs3Q6ZWQ7 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Spcs3Q6ZWQ7 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Spcs3Q6ZWQ7 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Spcs3Q6ZWQ7 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Spcs3Q6ZWQ7 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Spcs3Q6ZWQ7 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Spcs3Q6ZWQ7 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Spcs3Q6ZWQ7 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Spcs3Q6ZWQ7 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Spcs3Q6ZWQ7 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Spcs3Q6ZWQ7 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Spcs3Q6ZWQ7 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms