Protein–RNA interactions for Protein: Q6YND2

Znf653, Zinc finger protein 653, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf653Q6YND2 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Znf653Q6YND2 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Znf653Q6YND2 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Znf653Q6YND2 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Znf653Q6YND2 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Znf653Q6YND2 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Znf653Q6YND2 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Znf653Q6YND2 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Znf653Q6YND2 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Znf653Q6YND2 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Znf653Q6YND2 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Znf653Q6YND2 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Znf653Q6YND2 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Znf653Q6YND2 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Znf653Q6YND2 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Znf653Q6YND2 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Znf653Q6YND2 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Znf653Q6YND2 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Znf653Q6YND2 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Znf653Q6YND2 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Znf653Q6YND2 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Znf653Q6YND2 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Znf653Q6YND2 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Znf653Q6YND2 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Znf653Q6YND2 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Znf653Q6YND2 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Znf653Q6YND2 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Znf653Q6YND2 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Znf653Q6YND2 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Znf653Q6YND2 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Znf653Q6YND2 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Znf653Q6YND2 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Znf653Q6YND2 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Znf653Q6YND2 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Znf653Q6YND2 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Znf653Q6YND2 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Znf653Q6YND2 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Znf653Q6YND2 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Znf653Q6YND2 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Znf653Q6YND2 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Znf653Q6YND2 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Znf653Q6YND2 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Znf653Q6YND2 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Znf653Q6YND2 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Znf653Q6YND2 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Znf653Q6YND2 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Znf653Q6YND2 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Znf653Q6YND2 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Znf653Q6YND2 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Znf653Q6YND2 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Znf653Q6YND2 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Znf653Q6YND2 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Znf653Q6YND2 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Znf653Q6YND2 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Znf653Q6YND2 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Znf653Q6YND2 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Znf653Q6YND2 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Znf653Q6YND2 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Znf653Q6YND2 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Znf653Q6YND2 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Znf653Q6YND2 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Znf653Q6YND2 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Znf653Q6YND2 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Znf653Q6YND2 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Znf653Q6YND2 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Znf653Q6YND2 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Znf653Q6YND2 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Znf653Q6YND2 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Znf653Q6YND2 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Znf653Q6YND2 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Znf653Q6YND2 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Znf653Q6YND2 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Znf653Q6YND2 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Znf653Q6YND2 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Znf653Q6YND2 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Znf653Q6YND2 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Znf653Q6YND2 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Znf653Q6YND2 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Znf653Q6YND2 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Znf653Q6YND2 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Znf653Q6YND2 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Znf653Q6YND2 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Znf653Q6YND2 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Znf653Q6YND2 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Znf653Q6YND2 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Znf653Q6YND2 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Znf653Q6YND2 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Znf653Q6YND2 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Znf653Q6YND2 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Znf653Q6YND2 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Znf653Q6YND2 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Znf653Q6YND2 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Znf653Q6YND2 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Znf653Q6YND2 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Znf653Q6YND2 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Znf653Q6YND2 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Znf653Q6YND2 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Znf653Q6YND2 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Znf653Q6YND2 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Znf653Q6YND2 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms