Protein–RNA interactions for Protein: Q6W3F0

P4ha3, Prolyl 4-hydroxylase subunit alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P4ha3Q6W3F0 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P4ha3Q6W3F0 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P4ha3Q6W3F0 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P4ha3Q6W3F0 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P4ha3Q6W3F0 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P4ha3Q6W3F0 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P4ha3Q6W3F0 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P4ha3Q6W3F0 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P4ha3Q6W3F0 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P4ha3Q6W3F0 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P4ha3Q6W3F0 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P4ha3Q6W3F0 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P4ha3Q6W3F0 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P4ha3Q6W3F0 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P4ha3Q6W3F0 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P4ha3Q6W3F0 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P4ha3Q6W3F0 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P4ha3Q6W3F0 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P4ha3Q6W3F0 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P4ha3Q6W3F0 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P4ha3Q6W3F0 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P4ha3Q6W3F0 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P4ha3Q6W3F0 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P4ha3Q6W3F0 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P4ha3Q6W3F0 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P4ha3Q6W3F0 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P4ha3Q6W3F0 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P4ha3Q6W3F0 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P4ha3Q6W3F0 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P4ha3Q6W3F0 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P4ha3Q6W3F0 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P4ha3Q6W3F0 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P4ha3Q6W3F0 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P4ha3Q6W3F0 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P4ha3Q6W3F0 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P4ha3Q6W3F0 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P4ha3Q6W3F0 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P4ha3Q6W3F0 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P4ha3Q6W3F0 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P4ha3Q6W3F0 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P4ha3Q6W3F0 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P4ha3Q6W3F0 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P4ha3Q6W3F0 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P4ha3Q6W3F0 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P4ha3Q6W3F0 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P4ha3Q6W3F0 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P4ha3Q6W3F0 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P4ha3Q6W3F0 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P4ha3Q6W3F0 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P4ha3Q6W3F0 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P4ha3Q6W3F0 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P4ha3Q6W3F0 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P4ha3Q6W3F0 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P4ha3Q6W3F0 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P4ha3Q6W3F0 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P4ha3Q6W3F0 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P4ha3Q6W3F0 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
P4ha3Q6W3F0 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P4ha3Q6W3F0 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P4ha3Q6W3F0 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P4ha3Q6W3F0 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P4ha3Q6W3F0 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P4ha3Q6W3F0 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
P4ha3Q6W3F0 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P4ha3Q6W3F0 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P4ha3Q6W3F0 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P4ha3Q6W3F0 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P4ha3Q6W3F0 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P4ha3Q6W3F0 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P4ha3Q6W3F0 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P4ha3Q6W3F0 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
P4ha3Q6W3F0 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P4ha3Q6W3F0 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P4ha3Q6W3F0 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P4ha3Q6W3F0 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P4ha3Q6W3F0 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P4ha3Q6W3F0 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P4ha3Q6W3F0 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P4ha3Q6W3F0 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P4ha3Q6W3F0 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16■□□□□ 0.15
P4ha3Q6W3F0 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P4ha3Q6W3F0 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
P4ha3Q6W3F0 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P4ha3Q6W3F0 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P4ha3Q6W3F0 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P4ha3Q6W3F0 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P4ha3Q6W3F0 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P4ha3Q6W3F0 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P4ha3Q6W3F0 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P4ha3Q6W3F0 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
P4ha3Q6W3F0 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P4ha3Q6W3F0 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P4ha3Q6W3F0 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16■□□□□ 0.15
P4ha3Q6W3F0 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P4ha3Q6W3F0 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P4ha3Q6W3F0 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16■□□□□ 0.15
P4ha3Q6W3F0 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P4ha3Q6W3F0 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P4ha3Q6W3F0 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P4ha3Q6W3F0 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.8 ms