Protein–RNA interactions for Protein: Q6VUP9

Tfap2e, Transcription factor AP-2-epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfap2eQ6VUP9 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tfap2eQ6VUP9 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tfap2eQ6VUP9 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tfap2eQ6VUP9 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tfap2eQ6VUP9 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tfap2eQ6VUP9 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tfap2eQ6VUP9 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tfap2eQ6VUP9 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tfap2eQ6VUP9 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tfap2eQ6VUP9 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tfap2eQ6VUP9 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tfap2eQ6VUP9 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tfap2eQ6VUP9 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tfap2eQ6VUP9 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tfap2eQ6VUP9 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tfap2eQ6VUP9 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tfap2eQ6VUP9 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tfap2eQ6VUP9 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tfap2eQ6VUP9 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tfap2eQ6VUP9 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tfap2eQ6VUP9 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tfap2eQ6VUP9 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tfap2eQ6VUP9 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tfap2eQ6VUP9 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tfap2eQ6VUP9 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tfap2eQ6VUP9 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tfap2eQ6VUP9 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tfap2eQ6VUP9 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tfap2eQ6VUP9 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tfap2eQ6VUP9 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tfap2eQ6VUP9 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tfap2eQ6VUP9 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tfap2eQ6VUP9 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tfap2eQ6VUP9 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tfap2eQ6VUP9 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tfap2eQ6VUP9 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tfap2eQ6VUP9 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tfap2eQ6VUP9 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tfap2eQ6VUP9 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tfap2eQ6VUP9 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tfap2eQ6VUP9 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tfap2eQ6VUP9 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tfap2eQ6VUP9 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tfap2eQ6VUP9 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tfap2eQ6VUP9 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tfap2eQ6VUP9 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tfap2eQ6VUP9 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tfap2eQ6VUP9 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tfap2eQ6VUP9 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tfap2eQ6VUP9 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tfap2eQ6VUP9 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tfap2eQ6VUP9 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tfap2eQ6VUP9 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tfap2eQ6VUP9 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tfap2eQ6VUP9 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tfap2eQ6VUP9 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tfap2eQ6VUP9 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tfap2eQ6VUP9 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tfap2eQ6VUP9 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tfap2eQ6VUP9 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tfap2eQ6VUP9 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tfap2eQ6VUP9 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tfap2eQ6VUP9 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tfap2eQ6VUP9 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tfap2eQ6VUP9 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tfap2eQ6VUP9 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tfap2eQ6VUP9 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tfap2eQ6VUP9 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tfap2eQ6VUP9 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tfap2eQ6VUP9 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tfap2eQ6VUP9 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tfap2eQ6VUP9 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tfap2eQ6VUP9 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tfap2eQ6VUP9 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tfap2eQ6VUP9 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tfap2eQ6VUP9 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tfap2eQ6VUP9 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tfap2eQ6VUP9 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tfap2eQ6VUP9 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tfap2eQ6VUP9 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tfap2eQ6VUP9 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tfap2eQ6VUP9 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tfap2eQ6VUP9 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tfap2eQ6VUP9 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tfap2eQ6VUP9 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tfap2eQ6VUP9 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tfap2eQ6VUP9 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tfap2eQ6VUP9 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tfap2eQ6VUP9 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tfap2eQ6VUP9 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tfap2eQ6VUP9 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tfap2eQ6VUP9 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tfap2eQ6VUP9 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tfap2eQ6VUP9 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tfap2eQ6VUP9 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tfap2eQ6VUP9 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tfap2eQ6VUP9 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tfap2eQ6VUP9 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tfap2eQ6VUP9 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tfap2eQ6VUP9 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms