Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc88cQ6VGS5 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc88cQ6VGS5 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc88cQ6VGS5 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc88cQ6VGS5 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc88cQ6VGS5 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc88cQ6VGS5 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc88cQ6VGS5 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc88cQ6VGS5 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc88cQ6VGS5 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc88cQ6VGS5 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc88cQ6VGS5 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc88cQ6VGS5 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc88cQ6VGS5 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc88cQ6VGS5 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc88cQ6VGS5 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc88cQ6VGS5 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc88cQ6VGS5 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc88cQ6VGS5 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc88cQ6VGS5 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc88cQ6VGS5 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc88cQ6VGS5 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc88cQ6VGS5 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc88cQ6VGS5 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc88cQ6VGS5 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc88cQ6VGS5 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc88cQ6VGS5 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc88cQ6VGS5 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc88cQ6VGS5 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc88cQ6VGS5 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc88cQ6VGS5 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc88cQ6VGS5 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc88cQ6VGS5 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc88cQ6VGS5 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc88cQ6VGS5 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc88cQ6VGS5 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc88cQ6VGS5 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc88cQ6VGS5 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc88cQ6VGS5 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc88cQ6VGS5 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc88cQ6VGS5 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc88cQ6VGS5 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc88cQ6VGS5 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc88cQ6VGS5 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc88cQ6VGS5 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc88cQ6VGS5 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc88cQ6VGS5 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc88cQ6VGS5 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc88cQ6VGS5 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc88cQ6VGS5 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc88cQ6VGS5 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc88cQ6VGS5 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc88cQ6VGS5 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc88cQ6VGS5 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc88cQ6VGS5 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc88cQ6VGS5 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc88cQ6VGS5 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc88cQ6VGS5 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc88cQ6VGS5 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc88cQ6VGS5 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc88cQ6VGS5 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc88cQ6VGS5 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc88cQ6VGS5 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc88cQ6VGS5 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc88cQ6VGS5 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc88cQ6VGS5 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc88cQ6VGS5 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc88cQ6VGS5 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc88cQ6VGS5 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc88cQ6VGS5 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc88cQ6VGS5 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc88cQ6VGS5 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc88cQ6VGS5 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc88cQ6VGS5 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc88cQ6VGS5 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc88cQ6VGS5 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc88cQ6VGS5 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc88cQ6VGS5 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc88cQ6VGS5 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc88cQ6VGS5 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc88cQ6VGS5 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc88cQ6VGS5 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc88cQ6VGS5 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc88cQ6VGS5 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc88cQ6VGS5 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc88cQ6VGS5 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc88cQ6VGS5 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc88cQ6VGS5 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Ccdc88cQ6VGS5 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Ccdc88cQ6VGS5 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Ccdc88cQ6VGS5 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
Ccdc88cQ6VGS5 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
Ccdc88cQ6VGS5 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc88cQ6VGS5 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc88cQ6VGS5 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc88cQ6VGS5 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc88cQ6VGS5 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc88cQ6VGS5 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms