Protein–RNA interactions for Protein: Q6UGQ3

Scgb2b2, Secretoglobin family 2B member 2, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scgb2b2Q6UGQ3 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scgb2b2Q6UGQ3 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scgb2b2Q6UGQ3 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scgb2b2Q6UGQ3 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scgb2b2Q6UGQ3 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scgb2b2Q6UGQ3 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scgb2b2Q6UGQ3 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scgb2b2Q6UGQ3 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scgb2b2Q6UGQ3 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scgb2b2Q6UGQ3 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scgb2b2Q6UGQ3 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scgb2b2Q6UGQ3 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scgb2b2Q6UGQ3 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scgb2b2Q6UGQ3 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scgb2b2Q6UGQ3 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scgb2b2Q6UGQ3 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scgb2b2Q6UGQ3 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scgb2b2Q6UGQ3 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scgb2b2Q6UGQ3 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scgb2b2Q6UGQ3 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scgb2b2Q6UGQ3 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scgb2b2Q6UGQ3 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Scgb2b2Q6UGQ3 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scgb2b2Q6UGQ3 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scgb2b2Q6UGQ3 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scgb2b2Q6UGQ3 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scgb2b2Q6UGQ3 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scgb2b2Q6UGQ3 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scgb2b2Q6UGQ3 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scgb2b2Q6UGQ3 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Scgb2b2Q6UGQ3 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Scgb2b2Q6UGQ3 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Scgb2b2Q6UGQ3 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scgb2b2Q6UGQ3 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scgb2b2Q6UGQ3 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scgb2b2Q6UGQ3 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scgb2b2Q6UGQ3 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Scgb2b2Q6UGQ3 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Scgb2b2Q6UGQ3 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scgb2b2Q6UGQ3 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scgb2b2Q6UGQ3 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scgb2b2Q6UGQ3 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scgb2b2Q6UGQ3 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scgb2b2Q6UGQ3 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scgb2b2Q6UGQ3 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scgb2b2Q6UGQ3 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scgb2b2Q6UGQ3 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scgb2b2Q6UGQ3 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scgb2b2Q6UGQ3 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scgb2b2Q6UGQ3 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scgb2b2Q6UGQ3 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scgb2b2Q6UGQ3 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scgb2b2Q6UGQ3 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scgb2b2Q6UGQ3 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scgb2b2Q6UGQ3 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scgb2b2Q6UGQ3 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scgb2b2Q6UGQ3 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scgb2b2Q6UGQ3 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scgb2b2Q6UGQ3 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scgb2b2Q6UGQ3 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scgb2b2Q6UGQ3 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scgb2b2Q6UGQ3 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scgb2b2Q6UGQ3 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scgb2b2Q6UGQ3 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scgb2b2Q6UGQ3 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scgb2b2Q6UGQ3 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scgb2b2Q6UGQ3 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scgb2b2Q6UGQ3 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scgb2b2Q6UGQ3 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scgb2b2Q6UGQ3 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scgb2b2Q6UGQ3 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scgb2b2Q6UGQ3 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scgb2b2Q6UGQ3 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scgb2b2Q6UGQ3 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scgb2b2Q6UGQ3 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scgb2b2Q6UGQ3 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scgb2b2Q6UGQ3 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scgb2b2Q6UGQ3 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scgb2b2Q6UGQ3 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scgb2b2Q6UGQ3 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scgb2b2Q6UGQ3 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scgb2b2Q6UGQ3 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scgb2b2Q6UGQ3 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scgb2b2Q6UGQ3 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scgb2b2Q6UGQ3 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scgb2b2Q6UGQ3 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scgb2b2Q6UGQ3 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scgb2b2Q6UGQ3 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scgb2b2Q6UGQ3 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scgb2b2Q6UGQ3 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scgb2b2Q6UGQ3 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scgb2b2Q6UGQ3 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scgb2b2Q6UGQ3 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scgb2b2Q6UGQ3 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scgb2b2Q6UGQ3 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scgb2b2Q6UGQ3 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scgb2b2Q6UGQ3 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scgb2b2Q6UGQ3 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scgb2b2Q6UGQ3 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scgb2b2Q6UGQ3 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms