Protein–RNA interactions for Protein: Q6U7R4

Timd4, T-cell immunoglobulin and mucin domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timd4Q6U7R4 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Timd4Q6U7R4 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Timd4Q6U7R4 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Timd4Q6U7R4 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Timd4Q6U7R4 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Timd4Q6U7R4 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Timd4Q6U7R4 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Timd4Q6U7R4 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Timd4Q6U7R4 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Timd4Q6U7R4 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Timd4Q6U7R4 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Timd4Q6U7R4 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Timd4Q6U7R4 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Timd4Q6U7R4 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Timd4Q6U7R4 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Timd4Q6U7R4 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Timd4Q6U7R4 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Timd4Q6U7R4 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Timd4Q6U7R4 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Timd4Q6U7R4 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Timd4Q6U7R4 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Timd4Q6U7R4 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Timd4Q6U7R4 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Timd4Q6U7R4 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Timd4Q6U7R4 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Timd4Q6U7R4 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Timd4Q6U7R4 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Timd4Q6U7R4 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Timd4Q6U7R4 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Timd4Q6U7R4 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Timd4Q6U7R4 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Timd4Q6U7R4 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Timd4Q6U7R4 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Timd4Q6U7R4 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Timd4Q6U7R4 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Timd4Q6U7R4 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Timd4Q6U7R4 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Timd4Q6U7R4 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Timd4Q6U7R4 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Timd4Q6U7R4 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Timd4Q6U7R4 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Timd4Q6U7R4 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Timd4Q6U7R4 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Timd4Q6U7R4 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Timd4Q6U7R4 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Timd4Q6U7R4 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Timd4Q6U7R4 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Timd4Q6U7R4 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Timd4Q6U7R4 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Timd4Q6U7R4 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Timd4Q6U7R4 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Timd4Q6U7R4 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Timd4Q6U7R4 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Timd4Q6U7R4 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Timd4Q6U7R4 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Timd4Q6U7R4 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Timd4Q6U7R4 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Timd4Q6U7R4 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Timd4Q6U7R4 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Timd4Q6U7R4 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Timd4Q6U7R4 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Timd4Q6U7R4 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Timd4Q6U7R4 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Timd4Q6U7R4 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Timd4Q6U7R4 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Timd4Q6U7R4 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Timd4Q6U7R4 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Timd4Q6U7R4 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Timd4Q6U7R4 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Timd4Q6U7R4 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Timd4Q6U7R4 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Timd4Q6U7R4 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Timd4Q6U7R4 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Timd4Q6U7R4 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Timd4Q6U7R4 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Timd4Q6U7R4 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Timd4Q6U7R4 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Timd4Q6U7R4 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Timd4Q6U7R4 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Timd4Q6U7R4 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Timd4Q6U7R4 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Timd4Q6U7R4 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Timd4Q6U7R4 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Timd4Q6U7R4 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Timd4Q6U7R4 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Timd4Q6U7R4 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Timd4Q6U7R4 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Timd4Q6U7R4 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Timd4Q6U7R4 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Timd4Q6U7R4 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Timd4Q6U7R4 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Timd4Q6U7R4 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Timd4Q6U7R4 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Timd4Q6U7R4 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Timd4Q6U7R4 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Timd4Q6U7R4 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Timd4Q6U7R4 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Timd4Q6U7R4 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Timd4Q6U7R4 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Timd4Q6U7R4 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms