Protein–RNA interactions for Protein: Q6SJQ7

Cd300lf, CMRF35-like molecule 1, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd300lfQ6SJQ7 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cd300lfQ6SJQ7 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cd300lfQ6SJQ7 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cd300lfQ6SJQ7 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Cd300lfQ6SJQ7 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Cd300lfQ6SJQ7 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cd300lfQ6SJQ7 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cd300lfQ6SJQ7 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cd300lfQ6SJQ7 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cd300lfQ6SJQ7 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cd300lfQ6SJQ7 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cd300lfQ6SJQ7 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cd300lfQ6SJQ7 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cd300lfQ6SJQ7 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cd300lfQ6SJQ7 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cd300lfQ6SJQ7 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Cd300lfQ6SJQ7 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cd300lfQ6SJQ7 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cd300lfQ6SJQ7 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cd300lfQ6SJQ7 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cd300lfQ6SJQ7 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cd300lfQ6SJQ7 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cd300lfQ6SJQ7 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cd300lfQ6SJQ7 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cd300lfQ6SJQ7 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cd300lfQ6SJQ7 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cd300lfQ6SJQ7 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cd300lfQ6SJQ7 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cd300lfQ6SJQ7 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cd300lfQ6SJQ7 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cd300lfQ6SJQ7 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cd300lfQ6SJQ7 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cd300lfQ6SJQ7 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cd300lfQ6SJQ7 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cd300lfQ6SJQ7 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cd300lfQ6SJQ7 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cd300lfQ6SJQ7 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cd300lfQ6SJQ7 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cd300lfQ6SJQ7 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cd300lfQ6SJQ7 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cd300lfQ6SJQ7 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cd300lfQ6SJQ7 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cd300lfQ6SJQ7 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cd300lfQ6SJQ7 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cd300lfQ6SJQ7 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cd300lfQ6SJQ7 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cd300lfQ6SJQ7 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cd300lfQ6SJQ7 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Cd300lfQ6SJQ7 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cd300lfQ6SJQ7 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cd300lfQ6SJQ7 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cd300lfQ6SJQ7 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cd300lfQ6SJQ7 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cd300lfQ6SJQ7 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cd300lfQ6SJQ7 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cd300lfQ6SJQ7 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cd300lfQ6SJQ7 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cd300lfQ6SJQ7 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cd300lfQ6SJQ7 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cd300lfQ6SJQ7 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cd300lfQ6SJQ7 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cd300lfQ6SJQ7 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cd300lfQ6SJQ7 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cd300lfQ6SJQ7 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cd300lfQ6SJQ7 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cd300lfQ6SJQ7 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cd300lfQ6SJQ7 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cd300lfQ6SJQ7 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cd300lfQ6SJQ7 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cd300lfQ6SJQ7 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Cd300lfQ6SJQ7 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cd300lfQ6SJQ7 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cd300lfQ6SJQ7 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cd300lfQ6SJQ7 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Cd300lfQ6SJQ7 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cd300lfQ6SJQ7 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cd300lfQ6SJQ7 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cd300lfQ6SJQ7 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cd300lfQ6SJQ7 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cd300lfQ6SJQ7 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cd300lfQ6SJQ7 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cd300lfQ6SJQ7 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cd300lfQ6SJQ7 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Cd300lfQ6SJQ7 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cd300lfQ6SJQ7 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Cd300lfQ6SJQ7 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cd300lfQ6SJQ7 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cd300lfQ6SJQ7 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cd300lfQ6SJQ7 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cd300lfQ6SJQ7 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cd300lfQ6SJQ7 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cd300lfQ6SJQ7 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cd300lfQ6SJQ7 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cd300lfQ6SJQ7 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cd300lfQ6SJQ7 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cd300lfQ6SJQ7 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cd300lfQ6SJQ7 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cd300lfQ6SJQ7 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cd300lfQ6SJQ7 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cd300lfQ6SJQ7 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms