Protein–RNA interactions for Protein: Q6PGF3

Med16, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 16, mousemouse

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med16Q6PGF3 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Med16Q6PGF3 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Med16Q6PGF3 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Med16Q6PGF3 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Med16Q6PGF3 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Med16Q6PGF3 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Med16Q6PGF3 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Med16Q6PGF3 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Med16Q6PGF3 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Med16Q6PGF3 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Med16Q6PGF3 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Med16Q6PGF3 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Med16Q6PGF3 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Med16Q6PGF3 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.14■□□□□ 0.34
Med16Q6PGF3 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Med16Q6PGF3 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Med16Q6PGF3 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Med16Q6PGF3 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Med16Q6PGF3 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Med16Q6PGF3 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Med16Q6PGF3 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Med16Q6PGF3 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Med16Q6PGF3 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Med16Q6PGF3 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Med16Q6PGF3 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Med16Q6PGF3 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Med16Q6PGF3 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Med16Q6PGF3 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Med16Q6PGF3 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Med16Q6PGF3 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Med16Q6PGF3 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Med16Q6PGF3 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Med16Q6PGF3 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Med16Q6PGF3 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Med16Q6PGF3 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Med16Q6PGF3 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Med16Q6PGF3 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Med16Q6PGF3 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Med16Q6PGF3 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Med16Q6PGF3 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Med16Q6PGF3 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Med16Q6PGF3 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Med16Q6PGF3 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Med16Q6PGF3 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Med16Q6PGF3 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Med16Q6PGF3 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Med16Q6PGF3 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Med16Q6PGF3 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Med16Q6PGF3 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Med16Q6PGF3 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Med16Q6PGF3 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Med16Q6PGF3 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Med16Q6PGF3 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Med16Q6PGF3 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Med16Q6PGF3 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Med16Q6PGF3 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Med16Q6PGF3 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Med16Q6PGF3 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Med16Q6PGF3 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Med16Q6PGF3 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Med16Q6PGF3 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Med16Q6PGF3 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Med16Q6PGF3 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Med16Q6PGF3 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Med16Q6PGF3 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Med16Q6PGF3 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Med16Q6PGF3 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Med16Q6PGF3 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Med16Q6PGF3 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Med16Q6PGF3 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Med16Q6PGF3 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Med16Q6PGF3 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Med16Q6PGF3 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Med16Q6PGF3 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Med16Q6PGF3 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Med16Q6PGF3 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Med16Q6PGF3 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Med16Q6PGF3 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Med16Q6PGF3 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Med16Q6PGF3 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Med16Q6PGF3 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Med16Q6PGF3 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Med16Q6PGF3 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Med16Q6PGF3 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Med16Q6PGF3 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Med16Q6PGF3 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Med16Q6PGF3 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Med16Q6PGF3 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Med16Q6PGF3 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Med16Q6PGF3 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Med16Q6PGF3 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Med16Q6PGF3 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Med16Q6PGF3 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Med16Q6PGF3 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Med16Q6PGF3 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Med16Q6PGF3 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Med16Q6PGF3 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Med16Q6PGF3 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Med16Q6PGF3 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Med16Q6PGF3 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms