Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEE2

Ctif, CBP80/20-dependent translation initiation factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 600 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtifQ6PEE2 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CtifQ6PEE2 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CtifQ6PEE2 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CtifQ6PEE2 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CtifQ6PEE2 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CtifQ6PEE2 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CtifQ6PEE2 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CtifQ6PEE2 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
CtifQ6PEE2 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CtifQ6PEE2 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CtifQ6PEE2 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CtifQ6PEE2 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CtifQ6PEE2 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CtifQ6PEE2 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CtifQ6PEE2 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CtifQ6PEE2 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CtifQ6PEE2 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CtifQ6PEE2 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CtifQ6PEE2 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CtifQ6PEE2 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CtifQ6PEE2 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CtifQ6PEE2 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CtifQ6PEE2 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CtifQ6PEE2 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CtifQ6PEE2 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CtifQ6PEE2 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CtifQ6PEE2 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CtifQ6PEE2 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CtifQ6PEE2 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CtifQ6PEE2 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CtifQ6PEE2 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CtifQ6PEE2 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CtifQ6PEE2 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CtifQ6PEE2 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CtifQ6PEE2 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CtifQ6PEE2 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CtifQ6PEE2 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CtifQ6PEE2 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CtifQ6PEE2 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CtifQ6PEE2 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CtifQ6PEE2 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CtifQ6PEE2 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CtifQ6PEE2 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CtifQ6PEE2 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CtifQ6PEE2 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CtifQ6PEE2 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CtifQ6PEE2 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CtifQ6PEE2 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CtifQ6PEE2 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CtifQ6PEE2 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CtifQ6PEE2 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CtifQ6PEE2 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CtifQ6PEE2 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CtifQ6PEE2 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CtifQ6PEE2 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CtifQ6PEE2 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CtifQ6PEE2 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CtifQ6PEE2 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CtifQ6PEE2 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CtifQ6PEE2 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CtifQ6PEE2 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CtifQ6PEE2 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CtifQ6PEE2 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CtifQ6PEE2 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CtifQ6PEE2 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CtifQ6PEE2 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CtifQ6PEE2 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CtifQ6PEE2 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CtifQ6PEE2 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CtifQ6PEE2 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CtifQ6PEE2 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CtifQ6PEE2 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CtifQ6PEE2 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CtifQ6PEE2 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CtifQ6PEE2 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CtifQ6PEE2 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CtifQ6PEE2 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CtifQ6PEE2 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CtifQ6PEE2 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CtifQ6PEE2 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CtifQ6PEE2 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CtifQ6PEE2 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CtifQ6PEE2 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CtifQ6PEE2 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CtifQ6PEE2 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CtifQ6PEE2 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CtifQ6PEE2 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CtifQ6PEE2 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CtifQ6PEE2 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CtifQ6PEE2 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CtifQ6PEE2 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CtifQ6PEE2 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CtifQ6PEE2 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CtifQ6PEE2 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CtifQ6PEE2 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CtifQ6PEE2 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CtifQ6PEE2 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CtifQ6PEE2 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CtifQ6PEE2 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CtifQ6PEE2 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms