Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDM4

Ccdc36, Interactor of HORMAD1 protein 1, mousemouse

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Length 574 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc36Q6PDM4 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc36Q6PDM4 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc36Q6PDM4 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc36Q6PDM4 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc36Q6PDM4 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc36Q6PDM4 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc36Q6PDM4 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc36Q6PDM4 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc36Q6PDM4 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc36Q6PDM4 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc36Q6PDM4 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc36Q6PDM4 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc36Q6PDM4 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc36Q6PDM4 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc36Q6PDM4 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc36Q6PDM4 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc36Q6PDM4 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc36Q6PDM4 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc36Q6PDM4 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc36Q6PDM4 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc36Q6PDM4 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc36Q6PDM4 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc36Q6PDM4 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc36Q6PDM4 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc36Q6PDM4 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc36Q6PDM4 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc36Q6PDM4 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc36Q6PDM4 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc36Q6PDM4 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc36Q6PDM4 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc36Q6PDM4 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc36Q6PDM4 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc36Q6PDM4 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc36Q6PDM4 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc36Q6PDM4 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc36Q6PDM4 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc36Q6PDM4 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc36Q6PDM4 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc36Q6PDM4 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc36Q6PDM4 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc36Q6PDM4 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc36Q6PDM4 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc36Q6PDM4 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc36Q6PDM4 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc36Q6PDM4 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc36Q6PDM4 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc36Q6PDM4 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc36Q6PDM4 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc36Q6PDM4 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc36Q6PDM4 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc36Q6PDM4 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc36Q6PDM4 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc36Q6PDM4 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc36Q6PDM4 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc36Q6PDM4 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc36Q6PDM4 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc36Q6PDM4 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc36Q6PDM4 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc36Q6PDM4 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc36Q6PDM4 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc36Q6PDM4 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc36Q6PDM4 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc36Q6PDM4 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc36Q6PDM4 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc36Q6PDM4 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc36Q6PDM4 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc36Q6PDM4 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc36Q6PDM4 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc36Q6PDM4 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc36Q6PDM4 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc36Q6PDM4 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc36Q6PDM4 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc36Q6PDM4 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc36Q6PDM4 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc36Q6PDM4 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc36Q6PDM4 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc36Q6PDM4 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc36Q6PDM4 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc36Q6PDM4 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc36Q6PDM4 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc36Q6PDM4 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc36Q6PDM4 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc36Q6PDM4 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc36Q6PDM4 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc36Q6PDM4 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc36Q6PDM4 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc36Q6PDM4 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc36Q6PDM4 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc36Q6PDM4 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc36Q6PDM4 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc36Q6PDM4 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc36Q6PDM4 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc36Q6PDM4 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc36Q6PDM4 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc36Q6PDM4 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc36Q6PDM4 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc36Q6PDM4 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc36Q6PDM4 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc36Q6PDM4 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc36Q6PDM4 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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