Protein–RNA interactions for Protein: Q6PB60

Bhlhb9, Protein BHLHb9, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhb9Q6PB60 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Bhlhb9Q6PB60 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Bhlhb9Q6PB60 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Bhlhb9Q6PB60 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Bhlhb9Q6PB60 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Bhlhb9Q6PB60 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Bhlhb9Q6PB60 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Bhlhb9Q6PB60 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Bhlhb9Q6PB60 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Bhlhb9Q6PB60 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Bhlhb9Q6PB60 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Bhlhb9Q6PB60 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Bhlhb9Q6PB60 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Bhlhb9Q6PB60 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Bhlhb9Q6PB60 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Bhlhb9Q6PB60 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Bhlhb9Q6PB60 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Bhlhb9Q6PB60 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Bhlhb9Q6PB60 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Bhlhb9Q6PB60 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Bhlhb9Q6PB60 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Bhlhb9Q6PB60 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Bhlhb9Q6PB60 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Bhlhb9Q6PB60 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Bhlhb9Q6PB60 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Bhlhb9Q6PB60 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Bhlhb9Q6PB60 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Bhlhb9Q6PB60 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Bhlhb9Q6PB60 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Bhlhb9Q6PB60 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Bhlhb9Q6PB60 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Bhlhb9Q6PB60 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Bhlhb9Q6PB60 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Bhlhb9Q6PB60 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Bhlhb9Q6PB60 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Bhlhb9Q6PB60 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Bhlhb9Q6PB60 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Bhlhb9Q6PB60 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Bhlhb9Q6PB60 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Bhlhb9Q6PB60 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Bhlhb9Q6PB60 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Bhlhb9Q6PB60 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Bhlhb9Q6PB60 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Bhlhb9Q6PB60 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Bhlhb9Q6PB60 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Bhlhb9Q6PB60 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Bhlhb9Q6PB60 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Bhlhb9Q6PB60 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Bhlhb9Q6PB60 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Bhlhb9Q6PB60 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Bhlhb9Q6PB60 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Bhlhb9Q6PB60 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Bhlhb9Q6PB60 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Bhlhb9Q6PB60 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Bhlhb9Q6PB60 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Bhlhb9Q6PB60 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Bhlhb9Q6PB60 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Bhlhb9Q6PB60 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Bhlhb9Q6PB60 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Bhlhb9Q6PB60 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Bhlhb9Q6PB60 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Bhlhb9Q6PB60 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Bhlhb9Q6PB60 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Bhlhb9Q6PB60 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Bhlhb9Q6PB60 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Bhlhb9Q6PB60 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Bhlhb9Q6PB60 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Bhlhb9Q6PB60 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Bhlhb9Q6PB60 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Bhlhb9Q6PB60 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Bhlhb9Q6PB60 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Bhlhb9Q6PB60 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Bhlhb9Q6PB60 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Bhlhb9Q6PB60 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Bhlhb9Q6PB60 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Bhlhb9Q6PB60 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Bhlhb9Q6PB60 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Bhlhb9Q6PB60 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Bhlhb9Q6PB60 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Bhlhb9Q6PB60 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Bhlhb9Q6PB60 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Bhlhb9Q6PB60 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Bhlhb9Q6PB60 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Bhlhb9Q6PB60 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Bhlhb9Q6PB60 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Bhlhb9Q6PB60 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Bhlhb9Q6PB60 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Bhlhb9Q6PB60 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Bhlhb9Q6PB60 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Bhlhb9Q6PB60 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Bhlhb9Q6PB60 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Bhlhb9Q6PB60 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Bhlhb9Q6PB60 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Bhlhb9Q6PB60 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Bhlhb9Q6PB60 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Bhlhb9Q6PB60 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Bhlhb9Q6PB60 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Bhlhb9Q6PB60 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Bhlhb9Q6PB60 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Bhlhb9Q6PB60 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms