Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAR5

Gapvd1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gapvd1Q6PAR5 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Gapvd1Q6PAR5 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Gapvd1Q6PAR5 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Gapvd1Q6PAR5 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Gapvd1Q6PAR5 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Gapvd1Q6PAR5 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Gapvd1Q6PAR5 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Gapvd1Q6PAR5 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Gapvd1Q6PAR5 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Gapvd1Q6PAR5 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Gapvd1Q6PAR5 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Gapvd1Q6PAR5 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Gapvd1Q6PAR5 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Gapvd1Q6PAR5 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Gapvd1Q6PAR5 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Gapvd1Q6PAR5 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Gapvd1Q6PAR5 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Gapvd1Q6PAR5 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Gapvd1Q6PAR5 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Gapvd1Q6PAR5 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Gapvd1Q6PAR5 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Gapvd1Q6PAR5 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Gapvd1Q6PAR5 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Gapvd1Q6PAR5 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Gapvd1Q6PAR5 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Gapvd1Q6PAR5 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Gapvd1Q6PAR5 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Gapvd1Q6PAR5 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Gapvd1Q6PAR5 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Gapvd1Q6PAR5 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Gapvd1Q6PAR5 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Gapvd1Q6PAR5 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Gapvd1Q6PAR5 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Gapvd1Q6PAR5 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Gapvd1Q6PAR5 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Gapvd1Q6PAR5 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Gapvd1Q6PAR5 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Gapvd1Q6PAR5 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Gapvd1Q6PAR5 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Gapvd1Q6PAR5 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Gapvd1Q6PAR5 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Gapvd1Q6PAR5 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Gapvd1Q6PAR5 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Gapvd1Q6PAR5 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Gapvd1Q6PAR5 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Gapvd1Q6PAR5 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Gapvd1Q6PAR5 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Gapvd1Q6PAR5 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Gapvd1Q6PAR5 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Gapvd1Q6PAR5 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Gapvd1Q6PAR5 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Gapvd1Q6PAR5 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Gapvd1Q6PAR5 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Gapvd1Q6PAR5 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Gapvd1Q6PAR5 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Gapvd1Q6PAR5 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Gapvd1Q6PAR5 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Gapvd1Q6PAR5 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Gapvd1Q6PAR5 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Gapvd1Q6PAR5 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Gapvd1Q6PAR5 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Gapvd1Q6PAR5 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Gapvd1Q6PAR5 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Gapvd1Q6PAR5 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Gapvd1Q6PAR5 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Gapvd1Q6PAR5 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Gapvd1Q6PAR5 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Gapvd1Q6PAR5 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Gapvd1Q6PAR5 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Gapvd1Q6PAR5 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Gapvd1Q6PAR5 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Gapvd1Q6PAR5 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Gapvd1Q6PAR5 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Gapvd1Q6PAR5 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Gapvd1Q6PAR5 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Gapvd1Q6PAR5 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Gapvd1Q6PAR5 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Gapvd1Q6PAR5 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Gapvd1Q6PAR5 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Gapvd1Q6PAR5 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Gapvd1Q6PAR5 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Gapvd1Q6PAR5 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Gapvd1Q6PAR5 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Gapvd1Q6PAR5 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Gapvd1Q6PAR5 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Gapvd1Q6PAR5 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Gapvd1Q6PAR5 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Gapvd1Q6PAR5 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Gapvd1Q6PAR5 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Gapvd1Q6PAR5 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Gapvd1Q6PAR5 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Gapvd1Q6PAR5 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Gapvd1Q6PAR5 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Gapvd1Q6PAR5 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Gapvd1Q6PAR5 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Gapvd1Q6PAR5 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Gapvd1Q6PAR5 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Gapvd1Q6PAR5 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Gapvd1Q6PAR5 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Gapvd1Q6PAR5 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms