Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9P0

Slf2, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slf2Q6P9P0 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slf2Q6P9P0 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slf2Q6P9P0 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slf2Q6P9P0 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slf2Q6P9P0 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slf2Q6P9P0 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slf2Q6P9P0 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slf2Q6P9P0 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slf2Q6P9P0 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slf2Q6P9P0 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slf2Q6P9P0 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slf2Q6P9P0 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slf2Q6P9P0 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slf2Q6P9P0 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slf2Q6P9P0 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slf2Q6P9P0 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Slf2Q6P9P0 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slf2Q6P9P0 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slf2Q6P9P0 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slf2Q6P9P0 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slf2Q6P9P0 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slf2Q6P9P0 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slf2Q6P9P0 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slf2Q6P9P0 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slf2Q6P9P0 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slf2Q6P9P0 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slf2Q6P9P0 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slf2Q6P9P0 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Slf2Q6P9P0 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slf2Q6P9P0 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Slf2Q6P9P0 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slf2Q6P9P0 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slf2Q6P9P0 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slf2Q6P9P0 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slf2Q6P9P0 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slf2Q6P9P0 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slf2Q6P9P0 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slf2Q6P9P0 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slf2Q6P9P0 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slf2Q6P9P0 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slf2Q6P9P0 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slf2Q6P9P0 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slf2Q6P9P0 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Slf2Q6P9P0 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slf2Q6P9P0 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slf2Q6P9P0 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Slf2Q6P9P0 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Slf2Q6P9P0 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slf2Q6P9P0 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slf2Q6P9P0 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slf2Q6P9P0 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slf2Q6P9P0 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Slf2Q6P9P0 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slf2Q6P9P0 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slf2Q6P9P0 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slf2Q6P9P0 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slf2Q6P9P0 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slf2Q6P9P0 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slf2Q6P9P0 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slf2Q6P9P0 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slf2Q6P9P0 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slf2Q6P9P0 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slf2Q6P9P0 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slf2Q6P9P0 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slf2Q6P9P0 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slf2Q6P9P0 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slf2Q6P9P0 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slf2Q6P9P0 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slf2Q6P9P0 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Slf2Q6P9P0 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Slf2Q6P9P0 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Slf2Q6P9P0 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Slf2Q6P9P0 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Slf2Q6P9P0 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Slf2Q6P9P0 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Slf2Q6P9P0 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Slf2Q6P9P0 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Slf2Q6P9P0 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slf2Q6P9P0 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slf2Q6P9P0 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slf2Q6P9P0 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slf2Q6P9P0 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slf2Q6P9P0 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slf2Q6P9P0 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slf2Q6P9P0 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slf2Q6P9P0 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slf2Q6P9P0 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slf2Q6P9P0 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slf2Q6P9P0 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slf2Q6P9P0 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slf2Q6P9P0 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slf2Q6P9P0 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Slf2Q6P9P0 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slf2Q6P9P0 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slf2Q6P9P0 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slf2Q6P9P0 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slf2Q6P9P0 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Slf2Q6P9P0 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slf2Q6P9P0 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slf2Q6P9P0 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms