Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5B0

Rrp12, RRP12-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,295 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp12Q6P5B0 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rrp12Q6P5B0 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rrp12Q6P5B0 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rrp12Q6P5B0 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rrp12Q6P5B0 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rrp12Q6P5B0 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rrp12Q6P5B0 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rrp12Q6P5B0 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rrp12Q6P5B0 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rrp12Q6P5B0 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rrp12Q6P5B0 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rrp12Q6P5B0 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rrp12Q6P5B0 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rrp12Q6P5B0 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rrp12Q6P5B0 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rrp12Q6P5B0 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rrp12Q6P5B0 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rrp12Q6P5B0 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rrp12Q6P5B0 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rrp12Q6P5B0 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rrp12Q6P5B0 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rrp12Q6P5B0 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rrp12Q6P5B0 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rrp12Q6P5B0 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rrp12Q6P5B0 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rrp12Q6P5B0 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rrp12Q6P5B0 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rrp12Q6P5B0 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rrp12Q6P5B0 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Rrp12Q6P5B0 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Rrp12Q6P5B0 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Rrp12Q6P5B0 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
Rrp12Q6P5B0 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rrp12Q6P5B0 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rrp12Q6P5B0 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rrp12Q6P5B0 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rrp12Q6P5B0 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rrp12Q6P5B0 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rrp12Q6P5B0 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rrp12Q6P5B0 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rrp12Q6P5B0 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rrp12Q6P5B0 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rrp12Q6P5B0 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rrp12Q6P5B0 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rrp12Q6P5B0 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rrp12Q6P5B0 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rrp12Q6P5B0 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rrp12Q6P5B0 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rrp12Q6P5B0 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rrp12Q6P5B0 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rrp12Q6P5B0 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rrp12Q6P5B0 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rrp12Q6P5B0 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rrp12Q6P5B0 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rrp12Q6P5B0 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rrp12Q6P5B0 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rrp12Q6P5B0 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rrp12Q6P5B0 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rrp12Q6P5B0 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rrp12Q6P5B0 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rrp12Q6P5B0 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rrp12Q6P5B0 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rrp12Q6P5B0 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rrp12Q6P5B0 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rrp12Q6P5B0 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Rrp12Q6P5B0 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rrp12Q6P5B0 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rrp12Q6P5B0 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rrp12Q6P5B0 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rrp12Q6P5B0 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rrp12Q6P5B0 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rrp12Q6P5B0 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rrp12Q6P5B0 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rrp12Q6P5B0 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rrp12Q6P5B0 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rrp12Q6P5B0 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rrp12Q6P5B0 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Rrp12Q6P5B0 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rrp12Q6P5B0 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rrp12Q6P5B0 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rrp12Q6P5B0 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rrp12Q6P5B0 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rrp12Q6P5B0 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Rrp12Q6P5B0 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rrp12Q6P5B0 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rrp12Q6P5B0 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rrp12Q6P5B0 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rrp12Q6P5B0 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rrp12Q6P5B0 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rrp12Q6P5B0 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rrp12Q6P5B0 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rrp12Q6P5B0 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rrp12Q6P5B0 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rrp12Q6P5B0 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Rrp12Q6P5B0 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rrp12Q6P5B0 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rrp12Q6P5B0 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rrp12Q6P5B0 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rrp12Q6P5B0 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rrp12Q6P5B0 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.4 ms