Protein–RNA interactions for Protein: Q6P539

Fam222b, Protein FAM222B, mousemouse

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam222bQ6P539 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fam222bQ6P539 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Fam222bQ6P539 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fam222bQ6P539 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fam222bQ6P539 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fam222bQ6P539 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fam222bQ6P539 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fam222bQ6P539 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fam222bQ6P539 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Fam222bQ6P539 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fam222bQ6P539 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fam222bQ6P539 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fam222bQ6P539 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fam222bQ6P539 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fam222bQ6P539 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fam222bQ6P539 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Fam222bQ6P539 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fam222bQ6P539 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fam222bQ6P539 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Fam222bQ6P539 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fam222bQ6P539 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fam222bQ6P539 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fam222bQ6P539 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fam222bQ6P539 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fam222bQ6P539 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam222bQ6P539 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam222bQ6P539 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam222bQ6P539 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam222bQ6P539 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam222bQ6P539 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam222bQ6P539 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam222bQ6P539 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam222bQ6P539 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam222bQ6P539 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam222bQ6P539 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam222bQ6P539 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam222bQ6P539 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam222bQ6P539 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam222bQ6P539 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam222bQ6P539 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam222bQ6P539 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam222bQ6P539 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam222bQ6P539 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam222bQ6P539 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam222bQ6P539 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam222bQ6P539 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam222bQ6P539 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam222bQ6P539 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam222bQ6P539 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam222bQ6P539 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam222bQ6P539 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam222bQ6P539 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam222bQ6P539 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam222bQ6P539 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam222bQ6P539 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam222bQ6P539 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam222bQ6P539 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam222bQ6P539 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam222bQ6P539 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam222bQ6P539 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam222bQ6P539 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam222bQ6P539 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam222bQ6P539 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam222bQ6P539 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam222bQ6P539 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam222bQ6P539 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Fam222bQ6P539 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Fam222bQ6P539 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fam222bQ6P539 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fam222bQ6P539 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fam222bQ6P539 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fam222bQ6P539 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fam222bQ6P539 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fam222bQ6P539 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fam222bQ6P539 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fam222bQ6P539 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fam222bQ6P539 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fam222bQ6P539 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fam222bQ6P539 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fam222bQ6P539 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fam222bQ6P539 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fam222bQ6P539 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fam222bQ6P539 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fam222bQ6P539 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fam222bQ6P539 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fam222bQ6P539 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fam222bQ6P539 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fam222bQ6P539 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fam222bQ6P539 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fam222bQ6P539 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fam222bQ6P539 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fam222bQ6P539 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fam222bQ6P539 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fam222bQ6P539 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fam222bQ6P539 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fam222bQ6P539 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Fam222bQ6P539 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fam222bQ6P539 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fam222bQ6P539 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fam222bQ6P539 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms