Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZA9

Taf9b, Transcription initiation factor TFIID subunit 9B, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf9bQ6NZA9 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Taf9bQ6NZA9 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Taf9bQ6NZA9 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Taf9bQ6NZA9 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Taf9bQ6NZA9 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Taf9bQ6NZA9 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Taf9bQ6NZA9 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Taf9bQ6NZA9 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Taf9bQ6NZA9 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Taf9bQ6NZA9 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Taf9bQ6NZA9 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Taf9bQ6NZA9 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Taf9bQ6NZA9 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Taf9bQ6NZA9 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Taf9bQ6NZA9 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Taf9bQ6NZA9 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Taf9bQ6NZA9 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Taf9bQ6NZA9 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Taf9bQ6NZA9 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Taf9bQ6NZA9 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Taf9bQ6NZA9 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Taf9bQ6NZA9 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Taf9bQ6NZA9 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Taf9bQ6NZA9 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Taf9bQ6NZA9 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Taf9bQ6NZA9 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Taf9bQ6NZA9 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Taf9bQ6NZA9 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Taf9bQ6NZA9 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Taf9bQ6NZA9 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Taf9bQ6NZA9 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Taf9bQ6NZA9 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Taf9bQ6NZA9 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Taf9bQ6NZA9 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Taf9bQ6NZA9 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Taf9bQ6NZA9 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Taf9bQ6NZA9 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Taf9bQ6NZA9 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Taf9bQ6NZA9 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Taf9bQ6NZA9 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Taf9bQ6NZA9 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Taf9bQ6NZA9 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Taf9bQ6NZA9 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Taf9bQ6NZA9 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Taf9bQ6NZA9 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Taf9bQ6NZA9 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Taf9bQ6NZA9 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Taf9bQ6NZA9 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Taf9bQ6NZA9 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Taf9bQ6NZA9 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Taf9bQ6NZA9 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Taf9bQ6NZA9 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Taf9bQ6NZA9 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Taf9bQ6NZA9 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Taf9bQ6NZA9 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Taf9bQ6NZA9 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Taf9bQ6NZA9 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Taf9bQ6NZA9 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Taf9bQ6NZA9 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Taf9bQ6NZA9 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Taf9bQ6NZA9 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Taf9bQ6NZA9 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Taf9bQ6NZA9 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Taf9bQ6NZA9 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Taf9bQ6NZA9 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Taf9bQ6NZA9 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Taf9bQ6NZA9 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Taf9bQ6NZA9 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Taf9bQ6NZA9 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Taf9bQ6NZA9 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Taf9bQ6NZA9 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Taf9bQ6NZA9 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Taf9bQ6NZA9 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Taf9bQ6NZA9 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Taf9bQ6NZA9 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Taf9bQ6NZA9 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Taf9bQ6NZA9 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Taf9bQ6NZA9 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Taf9bQ6NZA9 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Taf9bQ6NZA9 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Taf9bQ6NZA9 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Taf9bQ6NZA9 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Taf9bQ6NZA9 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Taf9bQ6NZA9 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Taf9bQ6NZA9 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Taf9bQ6NZA9 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Taf9bQ6NZA9 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Taf9bQ6NZA9 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Taf9bQ6NZA9 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Taf9bQ6NZA9 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Taf9bQ6NZA9 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Taf9bQ6NZA9 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Taf9bQ6NZA9 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Taf9bQ6NZA9 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Taf9bQ6NZA9 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Taf9bQ6NZA9 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Taf9bQ6NZA9 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Taf9bQ6NZA9 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Taf9bQ6NZA9 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Taf9bQ6NZA9 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms