Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXN1

Szrd1, SUZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Szrd1Q6NXN1 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Szrd1Q6NXN1 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Szrd1Q6NXN1 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Szrd1Q6NXN1 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Szrd1Q6NXN1 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Szrd1Q6NXN1 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Szrd1Q6NXN1 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Szrd1Q6NXN1 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Szrd1Q6NXN1 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Szrd1Q6NXN1 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Szrd1Q6NXN1 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Szrd1Q6NXN1 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Szrd1Q6NXN1 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Szrd1Q6NXN1 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Szrd1Q6NXN1 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Szrd1Q6NXN1 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Szrd1Q6NXN1 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Szrd1Q6NXN1 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Szrd1Q6NXN1 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Szrd1Q6NXN1 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Szrd1Q6NXN1 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Szrd1Q6NXN1 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Szrd1Q6NXN1 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Szrd1Q6NXN1 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Szrd1Q6NXN1 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Szrd1Q6NXN1 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Szrd1Q6NXN1 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Szrd1Q6NXN1 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Szrd1Q6NXN1 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Szrd1Q6NXN1 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Szrd1Q6NXN1 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Szrd1Q6NXN1 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Szrd1Q6NXN1 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Szrd1Q6NXN1 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Szrd1Q6NXN1 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Szrd1Q6NXN1 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Szrd1Q6NXN1 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Szrd1Q6NXN1 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Szrd1Q6NXN1 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Szrd1Q6NXN1 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Szrd1Q6NXN1 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Szrd1Q6NXN1 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Szrd1Q6NXN1 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Szrd1Q6NXN1 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Szrd1Q6NXN1 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Szrd1Q6NXN1 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Szrd1Q6NXN1 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Szrd1Q6NXN1 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Szrd1Q6NXN1 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Szrd1Q6NXN1 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Szrd1Q6NXN1 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Szrd1Q6NXN1 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Szrd1Q6NXN1 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Szrd1Q6NXN1 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Szrd1Q6NXN1 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Szrd1Q6NXN1 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Szrd1Q6NXN1 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Szrd1Q6NXN1 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Szrd1Q6NXN1 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Szrd1Q6NXN1 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Szrd1Q6NXN1 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Szrd1Q6NXN1 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Szrd1Q6NXN1 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Szrd1Q6NXN1 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Szrd1Q6NXN1 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Szrd1Q6NXN1 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Szrd1Q6NXN1 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Szrd1Q6NXN1 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Szrd1Q6NXN1 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Szrd1Q6NXN1 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Szrd1Q6NXN1 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Szrd1Q6NXN1 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Szrd1Q6NXN1 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Szrd1Q6NXN1 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Szrd1Q6NXN1 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Szrd1Q6NXN1 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Szrd1Q6NXN1 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Szrd1Q6NXN1 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Szrd1Q6NXN1 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Szrd1Q6NXN1 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Szrd1Q6NXN1 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Szrd1Q6NXN1 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Szrd1Q6NXN1 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Szrd1Q6NXN1 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Szrd1Q6NXN1 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Szrd1Q6NXN1 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC17■□□□□ 0.31
Szrd1Q6NXN1 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Szrd1Q6NXN1 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Szrd1Q6NXN1 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Szrd1Q6NXN1 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Szrd1Q6NXN1 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Szrd1Q6NXN1 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Szrd1Q6NXN1 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Szrd1Q6NXN1 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Szrd1Q6NXN1 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Szrd1Q6NXN1 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Szrd1Q6NXN1 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Szrd1Q6NXN1 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Szrd1Q6NXN1 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Szrd1Q6NXN1 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms