Protein–RNA interactions for Protein: Q6KAU8

Atg16l2, Autophagy-related protein 16-2, mousemouse

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l2Q6KAU8 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atg16l2Q6KAU8 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atg16l2Q6KAU8 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atg16l2Q6KAU8 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atg16l2Q6KAU8 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atg16l2Q6KAU8 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atg16l2Q6KAU8 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atg16l2Q6KAU8 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Atg16l2Q6KAU8 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atg16l2Q6KAU8 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Atg16l2Q6KAU8 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atg16l2Q6KAU8 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Atg16l2Q6KAU8 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Atg16l2Q6KAU8 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Atg16l2Q6KAU8 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Atg16l2Q6KAU8 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Atg16l2Q6KAU8 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atg16l2Q6KAU8 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atg16l2Q6KAU8 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atg16l2Q6KAU8 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atg16l2Q6KAU8 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atg16l2Q6KAU8 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atg16l2Q6KAU8 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atg16l2Q6KAU8 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atg16l2Q6KAU8 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atg16l2Q6KAU8 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Atg16l2Q6KAU8 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atg16l2Q6KAU8 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atg16l2Q6KAU8 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atg16l2Q6KAU8 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atg16l2Q6KAU8 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atg16l2Q6KAU8 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atg16l2Q6KAU8 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atg16l2Q6KAU8 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atg16l2Q6KAU8 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atg16l2Q6KAU8 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atg16l2Q6KAU8 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atg16l2Q6KAU8 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atg16l2Q6KAU8 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atg16l2Q6KAU8 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atg16l2Q6KAU8 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atg16l2Q6KAU8 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atg16l2Q6KAU8 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atg16l2Q6KAU8 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atg16l2Q6KAU8 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atg16l2Q6KAU8 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atg16l2Q6KAU8 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atg16l2Q6KAU8 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atg16l2Q6KAU8 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atg16l2Q6KAU8 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atg16l2Q6KAU8 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atg16l2Q6KAU8 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atg16l2Q6KAU8 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atg16l2Q6KAU8 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atg16l2Q6KAU8 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atg16l2Q6KAU8 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atg16l2Q6KAU8 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atg16l2Q6KAU8 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atg16l2Q6KAU8 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atg16l2Q6KAU8 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Atg16l2Q6KAU8 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atg16l2Q6KAU8 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atg16l2Q6KAU8 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atg16l2Q6KAU8 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atg16l2Q6KAU8 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atg16l2Q6KAU8 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atg16l2Q6KAU8 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atg16l2Q6KAU8 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Atg16l2Q6KAU8 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atg16l2Q6KAU8 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atg16l2Q6KAU8 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atg16l2Q6KAU8 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atg16l2Q6KAU8 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atg16l2Q6KAU8 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atg16l2Q6KAU8 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atg16l2Q6KAU8 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atg16l2Q6KAU8 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atg16l2Q6KAU8 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atg16l2Q6KAU8 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atg16l2Q6KAU8 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Atg16l2Q6KAU8 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Atg16l2Q6KAU8 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atg16l2Q6KAU8 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atg16l2Q6KAU8 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atg16l2Q6KAU8 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Atg16l2Q6KAU8 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atg16l2Q6KAU8 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atg16l2Q6KAU8 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atg16l2Q6KAU8 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Atg16l2Q6KAU8 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atg16l2Q6KAU8 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atg16l2Q6KAU8 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atg16l2Q6KAU8 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atg16l2Q6KAU8 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atg16l2Q6KAU8 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atg16l2Q6KAU8 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atg16l2Q6KAU8 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atg16l2Q6KAU8 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atg16l2Q6KAU8 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atg16l2Q6KAU8 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms