Protein–RNA interactions for Protein: Q6K1E7

Ggnbp1, Gametogenetin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggnbp1Q6K1E7 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ggnbp1Q6K1E7 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ggnbp1Q6K1E7 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ggnbp1Q6K1E7 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ggnbp1Q6K1E7 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ggnbp1Q6K1E7 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ggnbp1Q6K1E7 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ggnbp1Q6K1E7 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ggnbp1Q6K1E7 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ggnbp1Q6K1E7 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ggnbp1Q6K1E7 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ggnbp1Q6K1E7 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ggnbp1Q6K1E7 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ggnbp1Q6K1E7 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ggnbp1Q6K1E7 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ggnbp1Q6K1E7 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ggnbp1Q6K1E7 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ggnbp1Q6K1E7 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ggnbp1Q6K1E7 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ggnbp1Q6K1E7 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ggnbp1Q6K1E7 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ggnbp1Q6K1E7 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ggnbp1Q6K1E7 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ggnbp1Q6K1E7 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ggnbp1Q6K1E7 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ggnbp1Q6K1E7 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ggnbp1Q6K1E7 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ggnbp1Q6K1E7 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ggnbp1Q6K1E7 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ggnbp1Q6K1E7 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ggnbp1Q6K1E7 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ggnbp1Q6K1E7 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ggnbp1Q6K1E7 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ggnbp1Q6K1E7 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ggnbp1Q6K1E7 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ggnbp1Q6K1E7 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ggnbp1Q6K1E7 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ggnbp1Q6K1E7 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ggnbp1Q6K1E7 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ggnbp1Q6K1E7 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ggnbp1Q6K1E7 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ggnbp1Q6K1E7 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ggnbp1Q6K1E7 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ggnbp1Q6K1E7 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ggnbp1Q6K1E7 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ggnbp1Q6K1E7 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Ggnbp1Q6K1E7 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Ggnbp1Q6K1E7 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ggnbp1Q6K1E7 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ggnbp1Q6K1E7 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ggnbp1Q6K1E7 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ggnbp1Q6K1E7 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ggnbp1Q6K1E7 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ggnbp1Q6K1E7 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ggnbp1Q6K1E7 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Ggnbp1Q6K1E7 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ggnbp1Q6K1E7 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ggnbp1Q6K1E7 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ggnbp1Q6K1E7 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ggnbp1Q6K1E7 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ggnbp1Q6K1E7 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ggnbp1Q6K1E7 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ggnbp1Q6K1E7 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ggnbp1Q6K1E7 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ggnbp1Q6K1E7 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
Ggnbp1Q6K1E7 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ggnbp1Q6K1E7 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ggnbp1Q6K1E7 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ggnbp1Q6K1E7 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ggnbp1Q6K1E7 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ggnbp1Q6K1E7 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Ggnbp1Q6K1E7 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ggnbp1Q6K1E7 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ggnbp1Q6K1E7 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Ggnbp1Q6K1E7 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ggnbp1Q6K1E7 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ggnbp1Q6K1E7 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ggnbp1Q6K1E7 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ggnbp1Q6K1E7 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ggnbp1Q6K1E7 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ggnbp1Q6K1E7 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ggnbp1Q6K1E7 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ggnbp1Q6K1E7 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ggnbp1Q6K1E7 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ggnbp1Q6K1E7 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ggnbp1Q6K1E7 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ggnbp1Q6K1E7 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ggnbp1Q6K1E7 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ggnbp1Q6K1E7 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ggnbp1Q6K1E7 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ggnbp1Q6K1E7 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ggnbp1Q6K1E7 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ggnbp1Q6K1E7 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ggnbp1Q6K1E7 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ggnbp1Q6K1E7 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ggnbp1Q6K1E7 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Ggnbp1Q6K1E7 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Ggnbp1Q6K1E7 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ggnbp1Q6K1E7 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ggnbp1Q6K1E7 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms