Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFZ6

Krt77, Keratin, type II cytoskeletal 1b, mousemouse

Predictions only

Length 572 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt77Q6IFZ6 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Krt77Q6IFZ6 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Krt77Q6IFZ6 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Krt77Q6IFZ6 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Krt77Q6IFZ6 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Krt77Q6IFZ6 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Krt77Q6IFZ6 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Krt77Q6IFZ6 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt77Q6IFZ6 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt77Q6IFZ6 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt77Q6IFZ6 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt77Q6IFZ6 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt77Q6IFZ6 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt77Q6IFZ6 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt77Q6IFZ6 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt77Q6IFZ6 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt77Q6IFZ6 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt77Q6IFZ6 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt77Q6IFZ6 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt77Q6IFZ6 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt77Q6IFZ6 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt77Q6IFZ6 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt77Q6IFZ6 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt77Q6IFZ6 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt77Q6IFZ6 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt77Q6IFZ6 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt77Q6IFZ6 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Krt77Q6IFZ6 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Krt77Q6IFZ6 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Krt77Q6IFZ6 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Krt77Q6IFZ6 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Krt77Q6IFZ6 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Krt77Q6IFZ6 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Krt77Q6IFZ6 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Krt77Q6IFZ6 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Krt77Q6IFZ6 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Krt77Q6IFZ6 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Krt77Q6IFZ6 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Krt77Q6IFZ6 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Krt77Q6IFZ6 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Krt77Q6IFZ6 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Krt77Q6IFZ6 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Krt77Q6IFZ6 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Krt77Q6IFZ6 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Krt77Q6IFZ6 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Krt77Q6IFZ6 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Krt77Q6IFZ6 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Krt77Q6IFZ6 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Krt77Q6IFZ6 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Krt77Q6IFZ6 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Krt77Q6IFZ6 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Krt77Q6IFZ6 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Krt77Q6IFZ6 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Krt77Q6IFZ6 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Krt77Q6IFZ6 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
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Krt77Q6IFZ6 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
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Krt77Q6IFZ6 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Krt77Q6IFZ6 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Krt77Q6IFZ6 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Krt77Q6IFZ6 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Krt77Q6IFZ6 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Krt77Q6IFZ6 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Krt77Q6IFZ6 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
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Krt77Q6IFZ6 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt77Q6IFZ6 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt77Q6IFZ6 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt77Q6IFZ6 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt77Q6IFZ6 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt77Q6IFZ6 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt77Q6IFZ6 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt77Q6IFZ6 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt77Q6IFZ6 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt77Q6IFZ6 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt77Q6IFZ6 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt77Q6IFZ6 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt77Q6IFZ6 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt77Q6IFZ6 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt77Q6IFZ6 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt77Q6IFZ6 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt77Q6IFZ6 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt77Q6IFZ6 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt77Q6IFZ6 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt77Q6IFZ6 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt77Q6IFZ6 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt77Q6IFZ6 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt77Q6IFZ6 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt77Q6IFZ6 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt77Q6IFZ6 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt77Q6IFZ6 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt77Q6IFZ6 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt77Q6IFZ6 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt77Q6IFZ6 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt77Q6IFZ6 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
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