Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFU8

Zfp948, Zinc finger protein 948, mousemouse

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Length 667 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp948Q6DFU8 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zfp948Q6DFU8 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zfp948Q6DFU8 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
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Zfp948Q6DFU8 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zfp948Q6DFU8 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zfp948Q6DFU8 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zfp948Q6DFU8 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Zfp948Q6DFU8 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Zfp948Q6DFU8 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
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Zfp948Q6DFU8 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Zfp948Q6DFU8 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zfp948Q6DFU8 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zfp948Q6DFU8 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zfp948Q6DFU8 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zfp948Q6DFU8 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zfp948Q6DFU8 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Zfp948Q6DFU8 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zfp948Q6DFU8 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zfp948Q6DFU8 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zfp948Q6DFU8 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Zfp948Q6DFU8 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zfp948Q6DFU8 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Zfp948Q6DFU8 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Zfp948Q6DFU8 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Zfp948Q6DFU8 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Zfp948Q6DFU8 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zfp948Q6DFU8 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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Zfp948Q6DFU8 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zfp948Q6DFU8 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
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Zfp948Q6DFU8 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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Zfp948Q6DFU8 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zfp948Q6DFU8 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zfp948Q6DFU8 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zfp948Q6DFU8 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zfp948Q6DFU8 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zfp948Q6DFU8 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Zfp948Q6DFU8 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zfp948Q6DFU8 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zfp948Q6DFU8 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zfp948Q6DFU8 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zfp948Q6DFU8 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zfp948Q6DFU8 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zfp948Q6DFU8 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zfp948Q6DFU8 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zfp948Q6DFU8 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zfp948Q6DFU8 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zfp948Q6DFU8 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zfp948Q6DFU8 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms