Protein–RNA interactions for Protein: Q68FG2

Sptbn2, Spectrin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 2,388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptbn2Q68FG2 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sptbn2Q68FG2 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sptbn2Q68FG2 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sptbn2Q68FG2 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Sptbn2Q68FG2 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sptbn2Q68FG2 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sptbn2Q68FG2 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sptbn2Q68FG2 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sptbn2Q68FG2 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sptbn2Q68FG2 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sptbn2Q68FG2 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sptbn2Q68FG2 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sptbn2Q68FG2 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sptbn2Q68FG2 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sptbn2Q68FG2 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sptbn2Q68FG2 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sptbn2Q68FG2 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sptbn2Q68FG2 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sptbn2Q68FG2 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sptbn2Q68FG2 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sptbn2Q68FG2 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sptbn2Q68FG2 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sptbn2Q68FG2 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sptbn2Q68FG2 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sptbn2Q68FG2 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sptbn2Q68FG2 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sptbn2Q68FG2 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sptbn2Q68FG2 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sptbn2Q68FG2 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sptbn2Q68FG2 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sptbn2Q68FG2 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sptbn2Q68FG2 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sptbn2Q68FG2 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sptbn2Q68FG2 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sptbn2Q68FG2 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sptbn2Q68FG2 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sptbn2Q68FG2 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sptbn2Q68FG2 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sptbn2Q68FG2 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sptbn2Q68FG2 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sptbn2Q68FG2 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Sptbn2Q68FG2 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sptbn2Q68FG2 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sptbn2Q68FG2 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sptbn2Q68FG2 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Sptbn2Q68FG2 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sptbn2Q68FG2 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sptbn2Q68FG2 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sptbn2Q68FG2 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sptbn2Q68FG2 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sptbn2Q68FG2 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sptbn2Q68FG2 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sptbn2Q68FG2 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sptbn2Q68FG2 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sptbn2Q68FG2 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sptbn2Q68FG2 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sptbn2Q68FG2 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sptbn2Q68FG2 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sptbn2Q68FG2 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sptbn2Q68FG2 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sptbn2Q68FG2 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sptbn2Q68FG2 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sptbn2Q68FG2 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sptbn2Q68FG2 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sptbn2Q68FG2 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sptbn2Q68FG2 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Sptbn2Q68FG2 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sptbn2Q68FG2 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sptbn2Q68FG2 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sptbn2Q68FG2 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sptbn2Q68FG2 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sptbn2Q68FG2 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sptbn2Q68FG2 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sptbn2Q68FG2 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sptbn2Q68FG2 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sptbn2Q68FG2 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Sptbn2Q68FG2 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Sptbn2Q68FG2 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sptbn2Q68FG2 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sptbn2Q68FG2 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sptbn2Q68FG2 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sptbn2Q68FG2 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sptbn2Q68FG2 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sptbn2Q68FG2 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sptbn2Q68FG2 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sptbn2Q68FG2 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sptbn2Q68FG2 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sptbn2Q68FG2 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sptbn2Q68FG2 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sptbn2Q68FG2 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sptbn2Q68FG2 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sptbn2Q68FG2 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sptbn2Q68FG2 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sptbn2Q68FG2 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sptbn2Q68FG2 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Sptbn2Q68FG2 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Sptbn2Q68FG2 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sptbn2Q68FG2 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sptbn2Q68FG2 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sptbn2Q68FG2 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73 ms