Protein–RNA interactions for Protein: Q66X22

Nlrp9b, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp9bQ66X22 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Nlrp9bQ66X22 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nlrp9bQ66X22 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nlrp9bQ66X22 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nlrp9bQ66X22 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nlrp9bQ66X22 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nlrp9bQ66X22 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nlrp9bQ66X22 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nlrp9bQ66X22 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nlrp9bQ66X22 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nlrp9bQ66X22 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nlrp9bQ66X22 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nlrp9bQ66X22 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nlrp9bQ66X22 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nlrp9bQ66X22 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nlrp9bQ66X22 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nlrp9bQ66X22 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nlrp9bQ66X22 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nlrp9bQ66X22 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nlrp9bQ66X22 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nlrp9bQ66X22 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nlrp9bQ66X22 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nlrp9bQ66X22 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nlrp9bQ66X22 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nlrp9bQ66X22 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nlrp9bQ66X22 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nlrp9bQ66X22 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nlrp9bQ66X22 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nlrp9bQ66X22 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nlrp9bQ66X22 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nlrp9bQ66X22 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Nlrp9bQ66X22 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nlrp9bQ66X22 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nlrp9bQ66X22 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nlrp9bQ66X22 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nlrp9bQ66X22 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nlrp9bQ66X22 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nlrp9bQ66X22 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nlrp9bQ66X22 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nlrp9bQ66X22 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Nlrp9bQ66X22 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Nlrp9bQ66X22 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Nlrp9bQ66X22 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nlrp9bQ66X22 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nlrp9bQ66X22 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Nlrp9bQ66X22 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nlrp9bQ66X22 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nlrp9bQ66X22 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nlrp9bQ66X22 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nlrp9bQ66X22 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nlrp9bQ66X22 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nlrp9bQ66X22 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nlrp9bQ66X22 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nlrp9bQ66X22 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Nlrp9bQ66X22 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nlrp9bQ66X22 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nlrp9bQ66X22 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nlrp9bQ66X22 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nlrp9bQ66X22 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nlrp9bQ66X22 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nlrp9bQ66X22 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nlrp9bQ66X22 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nlrp9bQ66X22 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Nlrp9bQ66X22 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Nlrp9bQ66X22 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nlrp9bQ66X22 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nlrp9bQ66X22 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nlrp9bQ66X22 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nlrp9bQ66X22 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Nlrp9bQ66X22 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nlrp9bQ66X22 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nlrp9bQ66X22 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nlrp9bQ66X22 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nlrp9bQ66X22 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nlrp9bQ66X22 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nlrp9bQ66X22 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Nlrp9bQ66X22 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nlrp9bQ66X22 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nlrp9bQ66X22 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Nlrp9bQ66X22 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nlrp9bQ66X22 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nlrp9bQ66X22 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nlrp9bQ66X22 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nlrp9bQ66X22 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nlrp9bQ66X22 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nlrp9bQ66X22 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nlrp9bQ66X22 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nlrp9bQ66X22 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nlrp9bQ66X22 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nlrp9bQ66X22 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nlrp9bQ66X22 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nlrp9bQ66X22 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nlrp9bQ66X22 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nlrp9bQ66X22 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nlrp9bQ66X22 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nlrp9bQ66X22 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Nlrp9bQ66X22 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nlrp9bQ66X22 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nlrp9bQ66X22 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nlrp9bQ66X22 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms