Protein–RNA interactions for Protein: Q64310

Surf4, Surfeit locus protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf4Q64310 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Surf4Q64310 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Surf4Q64310 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Surf4Q64310 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Surf4Q64310 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Surf4Q64310 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Surf4Q64310 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Surf4Q64310 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Surf4Q64310 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Surf4Q64310 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Surf4Q64310 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Surf4Q64310 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Surf4Q64310 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Surf4Q64310 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Surf4Q64310 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Surf4Q64310 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Surf4Q64310 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Surf4Q64310 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Surf4Q64310 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Surf4Q64310 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Surf4Q64310 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Surf4Q64310 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Surf4Q64310 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Surf4Q64310 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Surf4Q64310 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Surf4Q64310 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Surf4Q64310 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Surf4Q64310 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Surf4Q64310 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Surf4Q64310 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Surf4Q64310 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Surf4Q64310 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Surf4Q64310 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Surf4Q64310 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Surf4Q64310 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Surf4Q64310 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Surf4Q64310 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Surf4Q64310 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Surf4Q64310 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Surf4Q64310 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Surf4Q64310 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Surf4Q64310 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Surf4Q64310 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Surf4Q64310 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Surf4Q64310 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Surf4Q64310 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Surf4Q64310 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Surf4Q64310 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Surf4Q64310 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Surf4Q64310 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Surf4Q64310 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Surf4Q64310 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Surf4Q64310 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Surf4Q64310 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Surf4Q64310 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Surf4Q64310 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Surf4Q64310 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Surf4Q64310 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Surf4Q64310 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Surf4Q64310 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Surf4Q64310 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Surf4Q64310 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Surf4Q64310 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Surf4Q64310 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Surf4Q64310 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Surf4Q64310 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Surf4Q64310 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Surf4Q64310 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Surf4Q64310 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Surf4Q64310 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Surf4Q64310 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Surf4Q64310 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Surf4Q64310 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Surf4Q64310 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Surf4Q64310 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Surf4Q64310 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Surf4Q64310 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Surf4Q64310 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Surf4Q64310 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Surf4Q64310 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Surf4Q64310 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Surf4Q64310 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Surf4Q64310 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Surf4Q64310 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Surf4Q64310 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Surf4Q64310 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Surf4Q64310 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Surf4Q64310 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Surf4Q64310 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Surf4Q64310 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Surf4Q64310 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Surf4Q64310 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Surf4Q64310 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Surf4Q64310 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Surf4Q64310 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Surf4Q64310 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Surf4Q64310 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Surf4Q64310 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Surf4Q64310 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Surf4Q64310 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms