Protein–RNA interactions for Protein: Q62520

Zic2, Zinc finger protein ZIC 2, mousemouse

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zic2Q62520 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Zic2Q62520 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zic2Q62520 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zic2Q62520 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zic2Q62520 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Zic2Q62520 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zic2Q62520 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zic2Q62520 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Zic2Q62520 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zic2Q62520 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zic2Q62520 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zic2Q62520 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zic2Q62520 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zic2Q62520 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zic2Q62520 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zic2Q62520 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zic2Q62520 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zic2Q62520 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zic2Q62520 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zic2Q62520 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Zic2Q62520 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Zic2Q62520 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Zic2Q62520 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Zic2Q62520 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Zic2Q62520 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Zic2Q62520 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Zic2Q62520 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Zic2Q62520 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Zic2Q62520 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Zic2Q62520 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Zic2Q62520 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Zic2Q62520 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Zic2Q62520 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Zic2Q62520 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Zic2Q62520 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Zic2Q62520 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Zic2Q62520 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zic2Q62520 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zic2Q62520 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zic2Q62520 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Zic2Q62520 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zic2Q62520 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zic2Q62520 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zic2Q62520 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Zic2Q62520 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zic2Q62520 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Zic2Q62520 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zic2Q62520 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zic2Q62520 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zic2Q62520 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zic2Q62520 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zic2Q62520 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zic2Q62520 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zic2Q62520 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zic2Q62520 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zic2Q62520 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zic2Q62520 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zic2Q62520 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zic2Q62520 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zic2Q62520 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zic2Q62520 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Zic2Q62520 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Zic2Q62520 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zic2Q62520 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zic2Q62520 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zic2Q62520 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zic2Q62520 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zic2Q62520 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zic2Q62520 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zic2Q62520 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zic2Q62520 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zic2Q62520 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zic2Q62520 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zic2Q62520 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zic2Q62520 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zic2Q62520 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zic2Q62520 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zic2Q62520 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Zic2Q62520 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Zic2Q62520 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zic2Q62520 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zic2Q62520 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zic2Q62520 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zic2Q62520 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zic2Q62520 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zic2Q62520 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zic2Q62520 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zic2Q62520 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zic2Q62520 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zic2Q62520 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zic2Q62520 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zic2Q62520 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zic2Q62520 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Zic2Q62520 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zic2Q62520 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Zic2Q62520 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zic2Q62520 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zic2Q62520 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zic2Q62520 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zic2Q62520 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms