Protein–RNA interactions for Protein: Q62470

Itga3, Integrin alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga3Q62470 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Itga3Q62470 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Itga3Q62470 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Itga3Q62470 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Itga3Q62470 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Itga3Q62470 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Itga3Q62470 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Itga3Q62470 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Itga3Q62470 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Itga3Q62470 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Itga3Q62470 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Itga3Q62470 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Itga3Q62470 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Itga3Q62470 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Itga3Q62470 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Itga3Q62470 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Itga3Q62470 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Itga3Q62470 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Itga3Q62470 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Itga3Q62470 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Itga3Q62470 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Itga3Q62470 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Itga3Q62470 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Itga3Q62470 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Itga3Q62470 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Itga3Q62470 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Itga3Q62470 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Itga3Q62470 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Itga3Q62470 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Itga3Q62470 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Itga3Q62470 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Itga3Q62470 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Itga3Q62470 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Itga3Q62470 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Itga3Q62470 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Itga3Q62470 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Itga3Q62470 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Itga3Q62470 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Itga3Q62470 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Itga3Q62470 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Itga3Q62470 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Itga3Q62470 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Itga3Q62470 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Itga3Q62470 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Itga3Q62470 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Itga3Q62470 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Itga3Q62470 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Itga3Q62470 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Itga3Q62470 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Itga3Q62470 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Itga3Q62470 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Itga3Q62470 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Itga3Q62470 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Itga3Q62470 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Itga3Q62470 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Itga3Q62470 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Itga3Q62470 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Itga3Q62470 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Itga3Q62470 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Itga3Q62470 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Itga3Q62470 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Itga3Q62470 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Itga3Q62470 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Itga3Q62470 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Itga3Q62470 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Itga3Q62470 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Itga3Q62470 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Itga3Q62470 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Itga3Q62470 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Itga3Q62470 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Itga3Q62470 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Itga3Q62470 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Itga3Q62470 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Itga3Q62470 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Itga3Q62470 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Itga3Q62470 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Itga3Q62470 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Itga3Q62470 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Itga3Q62470 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Itga3Q62470 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Itga3Q62470 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Itga3Q62470 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Itga3Q62470 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Itga3Q62470 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Itga3Q62470 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Itga3Q62470 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Itga3Q62470 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Itga3Q62470 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Itga3Q62470 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Itga3Q62470 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Itga3Q62470 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Itga3Q62470 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Itga3Q62470 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Itga3Q62470 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Itga3Q62470 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Itga3Q62470 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Itga3Q62470 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Itga3Q62470 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Itga3Q62470 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Itga3Q62470 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms