Protein–RNA interactions for Protein: Q62361

Trh, Pro-thyrotropin-releasing hormone, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrhQ62361 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TrhQ62361 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TrhQ62361 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TrhQ62361 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TrhQ62361 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TrhQ62361 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TrhQ62361 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TrhQ62361 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TrhQ62361 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TrhQ62361 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TrhQ62361 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TrhQ62361 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TrhQ62361 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TrhQ62361 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TrhQ62361 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TrhQ62361 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TrhQ62361 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TrhQ62361 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TrhQ62361 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TrhQ62361 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TrhQ62361 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TrhQ62361 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TrhQ62361 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TrhQ62361 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TrhQ62361 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TrhQ62361 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TrhQ62361 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
TrhQ62361 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TrhQ62361 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TrhQ62361 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TrhQ62361 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TrhQ62361 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
TrhQ62361 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TrhQ62361 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TrhQ62361 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TrhQ62361 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TrhQ62361 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TrhQ62361 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TrhQ62361 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TrhQ62361 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
TrhQ62361 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TrhQ62361 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TrhQ62361 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TrhQ62361 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TrhQ62361 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TrhQ62361 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TrhQ62361 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TrhQ62361 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TrhQ62361 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TrhQ62361 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TrhQ62361 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TrhQ62361 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TrhQ62361 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TrhQ62361 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
TrhQ62361 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TrhQ62361 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TrhQ62361 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TrhQ62361 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TrhQ62361 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TrhQ62361 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TrhQ62361 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TrhQ62361 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TrhQ62361 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TrhQ62361 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TrhQ62361 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
TrhQ62361 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TrhQ62361 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TrhQ62361 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TrhQ62361 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TrhQ62361 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TrhQ62361 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TrhQ62361 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TrhQ62361 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TrhQ62361 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TrhQ62361 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TrhQ62361 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TrhQ62361 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TrhQ62361 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TrhQ62361 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TrhQ62361 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TrhQ62361 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TrhQ62361 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TrhQ62361 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
TrhQ62361 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TrhQ62361 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TrhQ62361 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TrhQ62361 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TrhQ62361 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
TrhQ62361 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TrhQ62361 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
TrhQ62361 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TrhQ62361 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TrhQ62361 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TrhQ62361 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TrhQ62361 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TrhQ62361 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TrhQ62361 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TrhQ62361 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TrhQ62361 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TrhQ62361 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms