Protein–RNA interactions for Protein: Q62261

Sptbn1, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptbn1Q62261 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Sptbn1Q62261 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sptbn1Q62261 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sptbn1Q62261 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sptbn1Q62261 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sptbn1Q62261 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sptbn1Q62261 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sptbn1Q62261 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sptbn1Q62261 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sptbn1Q62261 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sptbn1Q62261 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sptbn1Q62261 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sptbn1Q62261 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sptbn1Q62261 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sptbn1Q62261 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sptbn1Q62261 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Sptbn1Q62261 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sptbn1Q62261 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sptbn1Q62261 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sptbn1Q62261 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sptbn1Q62261 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sptbn1Q62261 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sptbn1Q62261 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sptbn1Q62261 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sptbn1Q62261 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sptbn1Q62261 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sptbn1Q62261 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sptbn1Q62261 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sptbn1Q62261 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Sptbn1Q62261 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sptbn1Q62261 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sptbn1Q62261 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Sptbn1Q62261 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sptbn1Q62261 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sptbn1Q62261 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sptbn1Q62261 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sptbn1Q62261 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sptbn1Q62261 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sptbn1Q62261 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sptbn1Q62261 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sptbn1Q62261 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sptbn1Q62261 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Sptbn1Q62261 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sptbn1Q62261 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sptbn1Q62261 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sptbn1Q62261 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sptbn1Q62261 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sptbn1Q62261 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Sptbn1Q62261 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sptbn1Q62261 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sptbn1Q62261 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Sptbn1Q62261 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sptbn1Q62261 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sptbn1Q62261 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sptbn1Q62261 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sptbn1Q62261 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sptbn1Q62261 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sptbn1Q62261 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sptbn1Q62261 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sptbn1Q62261 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sptbn1Q62261 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sptbn1Q62261 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sptbn1Q62261 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sptbn1Q62261 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sptbn1Q62261 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sptbn1Q62261 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sptbn1Q62261 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sptbn1Q62261 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sptbn1Q62261 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sptbn1Q62261 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sptbn1Q62261 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sptbn1Q62261 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sptbn1Q62261 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sptbn1Q62261 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sptbn1Q62261 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sptbn1Q62261 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sptbn1Q62261 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sptbn1Q62261 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sptbn1Q62261 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Sptbn1Q62261 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sptbn1Q62261 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sptbn1Q62261 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sptbn1Q62261 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sptbn1Q62261 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Sptbn1Q62261 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sptbn1Q62261 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sptbn1Q62261 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sptbn1Q62261 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sptbn1Q62261 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sptbn1Q62261 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sptbn1Q62261 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sptbn1Q62261 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sptbn1Q62261 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms