Protein–RNA interactions for Protein: Q62176

Rbm38, RNA-binding protein 38, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm38Q62176 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rbm38Q62176 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rbm38Q62176 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rbm38Q62176 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rbm38Q62176 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rbm38Q62176 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rbm38Q62176 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rbm38Q62176 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rbm38Q62176 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rbm38Q62176 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rbm38Q62176 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rbm38Q62176 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rbm38Q62176 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rbm38Q62176 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rbm38Q62176 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Rbm38Q62176 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rbm38Q62176 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rbm38Q62176 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rbm38Q62176 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rbm38Q62176 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rbm38Q62176 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rbm38Q62176 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rbm38Q62176 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rbm38Q62176 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rbm38Q62176 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rbm38Q62176 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rbm38Q62176 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rbm38Q62176 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Rbm38Q62176 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rbm38Q62176 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rbm38Q62176 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rbm38Q62176 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rbm38Q62176 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rbm38Q62176 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Rbm38Q62176 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rbm38Q62176 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rbm38Q62176 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rbm38Q62176 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rbm38Q62176 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Rbm38Q62176 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Rbm38Q62176 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rbm38Q62176 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rbm38Q62176 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rbm38Q62176 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rbm38Q62176 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Rbm38Q62176 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Rbm38Q62176 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rbm38Q62176 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rbm38Q62176 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rbm38Q62176 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rbm38Q62176 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rbm38Q62176 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rbm38Q62176 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rbm38Q62176 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rbm38Q62176 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rbm38Q62176 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rbm38Q62176 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rbm38Q62176 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rbm38Q62176 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rbm38Q62176 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rbm38Q62176 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Rbm38Q62176 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Rbm38Q62176 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rbm38Q62176 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rbm38Q62176 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rbm38Q62176 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rbm38Q62176 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rbm38Q62176 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rbm38Q62176 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rbm38Q62176 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rbm38Q62176 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rbm38Q62176 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rbm38Q62176 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rbm38Q62176 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rbm38Q62176 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rbm38Q62176 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rbm38Q62176 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rbm38Q62176 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rbm38Q62176 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rbm38Q62176 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rbm38Q62176 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rbm38Q62176 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rbm38Q62176 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rbm38Q62176 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rbm38Q62176 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rbm38Q62176 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rbm38Q62176 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rbm38Q62176 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rbm38Q62176 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rbm38Q62176 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rbm38Q62176 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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