Protein–RNA interactions for Protein: Q61687

Atrx, Transcriptional regulator ATRX, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtrxQ61687 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AtrxQ61687 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
AtrxQ61687 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AtrxQ61687 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
AtrxQ61687 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
AtrxQ61687 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
AtrxQ61687 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
AtrxQ61687 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AtrxQ61687 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
AtrxQ61687 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AtrxQ61687 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AtrxQ61687 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AtrxQ61687 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
AtrxQ61687 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AtrxQ61687 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AtrxQ61687 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
AtrxQ61687 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
AtrxQ61687 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AtrxQ61687 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
AtrxQ61687 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AtrxQ61687 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
AtrxQ61687 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
AtrxQ61687 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
AtrxQ61687 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
AtrxQ61687 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AtrxQ61687 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AtrxQ61687 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AtrxQ61687 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AtrxQ61687 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
AtrxQ61687 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
AtrxQ61687 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
AtrxQ61687 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
AtrxQ61687 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AtrxQ61687 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
AtrxQ61687 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AtrxQ61687 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
AtrxQ61687 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AtrxQ61687 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AtrxQ61687 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AtrxQ61687 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AtrxQ61687 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AtrxQ61687 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AtrxQ61687 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AtrxQ61687 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AtrxQ61687 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AtrxQ61687 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AtrxQ61687 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AtrxQ61687 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AtrxQ61687 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
AtrxQ61687 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AtrxQ61687 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AtrxQ61687 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AtrxQ61687 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
AtrxQ61687 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
AtrxQ61687 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
AtrxQ61687 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
AtrxQ61687 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
AtrxQ61687 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
AtrxQ61687 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
AtrxQ61687 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
AtrxQ61687 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
AtrxQ61687 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
AtrxQ61687 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
AtrxQ61687 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
AtrxQ61687 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AtrxQ61687 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AtrxQ61687 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AtrxQ61687 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AtrxQ61687 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AtrxQ61687 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AtrxQ61687 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AtrxQ61687 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AtrxQ61687 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AtrxQ61687 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AtrxQ61687 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AtrxQ61687 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AtrxQ61687 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AtrxQ61687 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AtrxQ61687 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AtrxQ61687 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
AtrxQ61687 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AtrxQ61687 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
AtrxQ61687 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AtrxQ61687 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AtrxQ61687 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AtrxQ61687 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AtrxQ61687 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AtrxQ61687 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
AtrxQ61687 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AtrxQ61687 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AtrxQ61687 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AtrxQ61687 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AtrxQ61687 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AtrxQ61687 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AtrxQ61687 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AtrxQ61687 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AtrxQ61687 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AtrxQ61687 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AtrxQ61687 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AtrxQ61687 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms