Protein–RNA interactions for Protein: Q61466

Smarcd1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcd1Q61466 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smarcd1Q61466 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smarcd1Q61466 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smarcd1Q61466 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Smarcd1Q61466 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smarcd1Q61466 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smarcd1Q61466 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smarcd1Q61466 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smarcd1Q61466 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smarcd1Q61466 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smarcd1Q61466 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smarcd1Q61466 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smarcd1Q61466 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smarcd1Q61466 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smarcd1Q61466 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smarcd1Q61466 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smarcd1Q61466 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Smarcd1Q61466 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smarcd1Q61466 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smarcd1Q61466 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smarcd1Q61466 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smarcd1Q61466 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smarcd1Q61466 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smarcd1Q61466 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smarcd1Q61466 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smarcd1Q61466 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smarcd1Q61466 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smarcd1Q61466 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smarcd1Q61466 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smarcd1Q61466 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smarcd1Q61466 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smarcd1Q61466 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smarcd1Q61466 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smarcd1Q61466 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smarcd1Q61466 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smarcd1Q61466 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smarcd1Q61466 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smarcd1Q61466 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smarcd1Q61466 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smarcd1Q61466 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smarcd1Q61466 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smarcd1Q61466 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smarcd1Q61466 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smarcd1Q61466 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smarcd1Q61466 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Smarcd1Q61466 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smarcd1Q61466 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smarcd1Q61466 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smarcd1Q61466 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Smarcd1Q61466 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smarcd1Q61466 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smarcd1Q61466 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smarcd1Q61466 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smarcd1Q61466 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smarcd1Q61466 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smarcd1Q61466 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smarcd1Q61466 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smarcd1Q61466 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smarcd1Q61466 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smarcd1Q61466 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smarcd1Q61466 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smarcd1Q61466 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smarcd1Q61466 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smarcd1Q61466 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smarcd1Q61466 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smarcd1Q61466 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smarcd1Q61466 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smarcd1Q61466 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smarcd1Q61466 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smarcd1Q61466 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smarcd1Q61466 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smarcd1Q61466 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smarcd1Q61466 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smarcd1Q61466 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smarcd1Q61466 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smarcd1Q61466 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smarcd1Q61466 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smarcd1Q61466 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Smarcd1Q61466 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smarcd1Q61466 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smarcd1Q61466 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smarcd1Q61466 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smarcd1Q61466 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smarcd1Q61466 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smarcd1Q61466 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smarcd1Q61466 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Smarcd1Q61466 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smarcd1Q61466 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smarcd1Q61466 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smarcd1Q61466 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Smarcd1Q61466 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Smarcd1Q61466 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Smarcd1Q61466 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Smarcd1Q61466 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Smarcd1Q61466 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Smarcd1Q61466 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Smarcd1Q61466 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Smarcd1Q61466 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Smarcd1Q61466 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Smarcd1Q61466 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms