Protein–RNA interactions for Protein: Q61451

Cd53, Leukocyte surface antigen CD53, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd53Q61451 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd53Q61451 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd53Q61451 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd53Q61451 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd53Q61451 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd53Q61451 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd53Q61451 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd53Q61451 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd53Q61451 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd53Q61451 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd53Q61451 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd53Q61451 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd53Q61451 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd53Q61451 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd53Q61451 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd53Q61451 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd53Q61451 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd53Q61451 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd53Q61451 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd53Q61451 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd53Q61451 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd53Q61451 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd53Q61451 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd53Q61451 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd53Q61451 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd53Q61451 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd53Q61451 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd53Q61451 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd53Q61451 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd53Q61451 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd53Q61451 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd53Q61451 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd53Q61451 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd53Q61451 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd53Q61451 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Cd53Q61451 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Cd53Q61451 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd53Q61451 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd53Q61451 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd53Q61451 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd53Q61451 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd53Q61451 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd53Q61451 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd53Q61451 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd53Q61451 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd53Q61451 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd53Q61451 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd53Q61451 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd53Q61451 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd53Q61451 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd53Q61451 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd53Q61451 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd53Q61451 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd53Q61451 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd53Q61451 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd53Q61451 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd53Q61451 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd53Q61451 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd53Q61451 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd53Q61451 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd53Q61451 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd53Q61451 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd53Q61451 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd53Q61451 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd53Q61451 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd53Q61451 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd53Q61451 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd53Q61451 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd53Q61451 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd53Q61451 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd53Q61451 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd53Q61451 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd53Q61451 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd53Q61451 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd53Q61451 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd53Q61451 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd53Q61451 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd53Q61451 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd53Q61451 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd53Q61451 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd53Q61451 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd53Q61451 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd53Q61451 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd53Q61451 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd53Q61451 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd53Q61451 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd53Q61451 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd53Q61451 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd53Q61451 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd53Q61451 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd53Q61451 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd53Q61451 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd53Q61451 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd53Q61451 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd53Q61451 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd53Q61451 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd53Q61451 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd53Q61451 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd53Q61451 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd53Q61451 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms