Protein–RNA interactions for Protein: Q61398

Pcolce, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcolceQ61398 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PcolceQ61398 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PcolceQ61398 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PcolceQ61398 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PcolceQ61398 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PcolceQ61398 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PcolceQ61398 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PcolceQ61398 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PcolceQ61398 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PcolceQ61398 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PcolceQ61398 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PcolceQ61398 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PcolceQ61398 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PcolceQ61398 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PcolceQ61398 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PcolceQ61398 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PcolceQ61398 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PcolceQ61398 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PcolceQ61398 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PcolceQ61398 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PcolceQ61398 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PcolceQ61398 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PcolceQ61398 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PcolceQ61398 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PcolceQ61398 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PcolceQ61398 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PcolceQ61398 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PcolceQ61398 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PcolceQ61398 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PcolceQ61398 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PcolceQ61398 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PcolceQ61398 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PcolceQ61398 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PcolceQ61398 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PcolceQ61398 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PcolceQ61398 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PcolceQ61398 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PcolceQ61398 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PcolceQ61398 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PcolceQ61398 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PcolceQ61398 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PcolceQ61398 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PcolceQ61398 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PcolceQ61398 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PcolceQ61398 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PcolceQ61398 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PcolceQ61398 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PcolceQ61398 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PcolceQ61398 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PcolceQ61398 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PcolceQ61398 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PcolceQ61398 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PcolceQ61398 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PcolceQ61398 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PcolceQ61398 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PcolceQ61398 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PcolceQ61398 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PcolceQ61398 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PcolceQ61398 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PcolceQ61398 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PcolceQ61398 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PcolceQ61398 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
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PcolceQ61398 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PcolceQ61398 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PcolceQ61398 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PcolceQ61398 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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PcolceQ61398 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PcolceQ61398 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PcolceQ61398 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PcolceQ61398 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PcolceQ61398 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PcolceQ61398 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PcolceQ61398 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PcolceQ61398 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PcolceQ61398 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PcolceQ61398 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PcolceQ61398 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PcolceQ61398 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PcolceQ61398 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PcolceQ61398 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PcolceQ61398 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PcolceQ61398 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PcolceQ61398 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PcolceQ61398 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PcolceQ61398 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PcolceQ61398 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PcolceQ61398 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PcolceQ61398 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PcolceQ61398 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PcolceQ61398 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PcolceQ61398 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PcolceQ61398 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PcolceQ61398 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PcolceQ61398 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PcolceQ61398 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PcolceQ61398 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PcolceQ61398 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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