Protein–RNA interactions for Protein: Q61165

Slc9a1, Sodium/hydrogen exchanger 1, mousemouse

Predictions only

Length 820 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc9a1Q61165 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc9a1Q61165 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc9a1Q61165 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc9a1Q61165 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc9a1Q61165 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc9a1Q61165 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc9a1Q61165 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc9a1Q61165 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc9a1Q61165 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc9a1Q61165 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc9a1Q61165 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc9a1Q61165 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc9a1Q61165 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc9a1Q61165 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc9a1Q61165 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc9a1Q61165 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc9a1Q61165 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc9a1Q61165 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc9a1Q61165 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc9a1Q61165 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc9a1Q61165 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc9a1Q61165 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc9a1Q61165 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc9a1Q61165 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc9a1Q61165 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc9a1Q61165 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc9a1Q61165 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc9a1Q61165 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc9a1Q61165 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc9a1Q61165 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc9a1Q61165 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc9a1Q61165 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc9a1Q61165 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc9a1Q61165 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc9a1Q61165 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc9a1Q61165 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc9a1Q61165 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc9a1Q61165 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc9a1Q61165 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc9a1Q61165 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc9a1Q61165 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc9a1Q61165 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc9a1Q61165 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc9a1Q61165 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slc9a1Q61165 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slc9a1Q61165 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slc9a1Q61165 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slc9a1Q61165 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slc9a1Q61165 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slc9a1Q61165 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Slc9a1Q61165 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slc9a1Q61165 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slc9a1Q61165 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slc9a1Q61165 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc9a1Q61165 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc9a1Q61165 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc9a1Q61165 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc9a1Q61165 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc9a1Q61165 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc9a1Q61165 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc9a1Q61165 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc9a1Q61165 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Slc9a1Q61165 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Slc9a1Q61165 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Slc9a1Q61165 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Slc9a1Q61165 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Slc9a1Q61165 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Slc9a1Q61165 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Slc9a1Q61165 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Slc9a1Q61165 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Slc9a1Q61165 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Slc9a1Q61165 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Slc9a1Q61165 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Slc9a1Q61165 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Slc9a1Q61165 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Slc9a1Q61165 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Slc9a1Q61165 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Slc9a1Q61165 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Slc9a1Q61165 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Slc9a1Q61165 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Slc9a1Q61165 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Slc9a1Q61165 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Slc9a1Q61165 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Slc9a1Q61165 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Slc9a1Q61165 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Slc9a1Q61165 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Slc9a1Q61165 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Slc9a1Q61165 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Slc9a1Q61165 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Slc9a1Q61165 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Slc9a1Q61165 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Slc9a1Q61165 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Slc9a1Q61165 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Slc9a1Q61165 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Slc9a1Q61165 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Slc9a1Q61165 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Slc9a1Q61165 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Slc9a1Q61165 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Slc9a1Q61165 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Slc9a1Q61165 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.3 ms