Protein–RNA interactions for Protein: Q61056

Trpc1, Short transient receptor potential channel 1, mousemouse

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc1Q61056 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trpc1Q61056 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trpc1Q61056 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trpc1Q61056 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trpc1Q61056 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trpc1Q61056 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trpc1Q61056 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trpc1Q61056 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trpc1Q61056 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trpc1Q61056 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trpc1Q61056 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trpc1Q61056 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trpc1Q61056 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trpc1Q61056 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trpc1Q61056 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trpc1Q61056 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trpc1Q61056 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trpc1Q61056 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trpc1Q61056 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Trpc1Q61056 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trpc1Q61056 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trpc1Q61056 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trpc1Q61056 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trpc1Q61056 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trpc1Q61056 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trpc1Q61056 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trpc1Q61056 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trpc1Q61056 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trpc1Q61056 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trpc1Q61056 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trpc1Q61056 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trpc1Q61056 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trpc1Q61056 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trpc1Q61056 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trpc1Q61056 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trpc1Q61056 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trpc1Q61056 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trpc1Q61056 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trpc1Q61056 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trpc1Q61056 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trpc1Q61056 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trpc1Q61056 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trpc1Q61056 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trpc1Q61056 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trpc1Q61056 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trpc1Q61056 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Trpc1Q61056 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Trpc1Q61056 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Trpc1Q61056 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Trpc1Q61056 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trpc1Q61056 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trpc1Q61056 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trpc1Q61056 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trpc1Q61056 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trpc1Q61056 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trpc1Q61056 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trpc1Q61056 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trpc1Q61056 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trpc1Q61056 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trpc1Q61056 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trpc1Q61056 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trpc1Q61056 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trpc1Q61056 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trpc1Q61056 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trpc1Q61056 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trpc1Q61056 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trpc1Q61056 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trpc1Q61056 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trpc1Q61056 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trpc1Q61056 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trpc1Q61056 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trpc1Q61056 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trpc1Q61056 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trpc1Q61056 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trpc1Q61056 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trpc1Q61056 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trpc1Q61056 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trpc1Q61056 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trpc1Q61056 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trpc1Q61056 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trpc1Q61056 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trpc1Q61056 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trpc1Q61056 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trpc1Q61056 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trpc1Q61056 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trpc1Q61056 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trpc1Q61056 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trpc1Q61056 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trpc1Q61056 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trpc1Q61056 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trpc1Q61056 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trpc1Q61056 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trpc1Q61056 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trpc1Q61056 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trpc1Q61056 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trpc1Q61056 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trpc1Q61056 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trpc1Q61056 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trpc1Q61056 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trpc1Q61056 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms