Protein–RNA interactions for Protein: Q60673

Ptprn, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprnQ60673 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
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PtprnQ60673 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
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PtprnQ60673 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PtprnQ60673 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PtprnQ60673 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
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PtprnQ60673 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
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PtprnQ60673 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
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PtprnQ60673 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PtprnQ60673 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PtprnQ60673 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
PtprnQ60673 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
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PtprnQ60673 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
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PtprnQ60673 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PtprnQ60673 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
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PtprnQ60673 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
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PtprnQ60673 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms