Protein–RNA interactions for Protein: Q60632

Nr2f1, COUP transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr2f1Q60632 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nr2f1Q60632 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nr2f1Q60632 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nr2f1Q60632 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nr2f1Q60632 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nr2f1Q60632 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nr2f1Q60632 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Nr2f1Q60632 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nr2f1Q60632 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nr2f1Q60632 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nr2f1Q60632 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nr2f1Q60632 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nr2f1Q60632 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nr2f1Q60632 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nr2f1Q60632 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nr2f1Q60632 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nr2f1Q60632 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nr2f1Q60632 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nr2f1Q60632 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nr2f1Q60632 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nr2f1Q60632 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nr2f1Q60632 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nr2f1Q60632 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nr2f1Q60632 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nr2f1Q60632 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nr2f1Q60632 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nr2f1Q60632 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nr2f1Q60632 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nr2f1Q60632 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nr2f1Q60632 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nr2f1Q60632 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nr2f1Q60632 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Nr2f1Q60632 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nr2f1Q60632 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nr2f1Q60632 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Nr2f1Q60632 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nr2f1Q60632 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nr2f1Q60632 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nr2f1Q60632 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nr2f1Q60632 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nr2f1Q60632 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nr2f1Q60632 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nr2f1Q60632 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nr2f1Q60632 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nr2f1Q60632 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nr2f1Q60632 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nr2f1Q60632 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Nr2f1Q60632 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Nr2f1Q60632 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nr2f1Q60632 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nr2f1Q60632 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nr2f1Q60632 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nr2f1Q60632 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nr2f1Q60632 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nr2f1Q60632 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nr2f1Q60632 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nr2f1Q60632 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nr2f1Q60632 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nr2f1Q60632 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nr2f1Q60632 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nr2f1Q60632 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nr2f1Q60632 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nr2f1Q60632 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nr2f1Q60632 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nr2f1Q60632 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Nr2f1Q60632 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nr2f1Q60632 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nr2f1Q60632 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nr2f1Q60632 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nr2f1Q60632 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nr2f1Q60632 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Nr2f1Q60632 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nr2f1Q60632 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nr2f1Q60632 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nr2f1Q60632 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nr2f1Q60632 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nr2f1Q60632 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nr2f1Q60632 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nr2f1Q60632 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nr2f1Q60632 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nr2f1Q60632 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nr2f1Q60632 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nr2f1Q60632 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nr2f1Q60632 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Nr2f1Q60632 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nr2f1Q60632 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nr2f1Q60632 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nr2f1Q60632 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nr2f1Q60632 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nr2f1Q60632 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Nr2f1Q60632 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nr2f1Q60632 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nr2f1Q60632 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nr2f1Q60632 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nr2f1Q60632 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nr2f1Q60632 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nr2f1Q60632 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nr2f1Q60632 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Nr2f1Q60632 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nr2f1Q60632 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms