Protein–RNA interactions for Protein: Q60520

Sin3a, Paired amphipathic helix protein Sin3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3aQ60520 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sin3aQ60520 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sin3aQ60520 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sin3aQ60520 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sin3aQ60520 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sin3aQ60520 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sin3aQ60520 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sin3aQ60520 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sin3aQ60520 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sin3aQ60520 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sin3aQ60520 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sin3aQ60520 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sin3aQ60520 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sin3aQ60520 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sin3aQ60520 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sin3aQ60520 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sin3aQ60520 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sin3aQ60520 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sin3aQ60520 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sin3aQ60520 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sin3aQ60520 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sin3aQ60520 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sin3aQ60520 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sin3aQ60520 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Sin3aQ60520 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Sin3aQ60520 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sin3aQ60520 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sin3aQ60520 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sin3aQ60520 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sin3aQ60520 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sin3aQ60520 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sin3aQ60520 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sin3aQ60520 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sin3aQ60520 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sin3aQ60520 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sin3aQ60520 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sin3aQ60520 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Sin3aQ60520 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sin3aQ60520 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sin3aQ60520 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sin3aQ60520 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sin3aQ60520 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sin3aQ60520 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sin3aQ60520 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Sin3aQ60520 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Sin3aQ60520 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Sin3aQ60520 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Sin3aQ60520 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Sin3aQ60520 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Sin3aQ60520 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Sin3aQ60520 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Sin3aQ60520 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Sin3aQ60520 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Sin3aQ60520 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Sin3aQ60520 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sin3aQ60520 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Sin3aQ60520 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sin3aQ60520 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sin3aQ60520 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sin3aQ60520 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sin3aQ60520 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sin3aQ60520 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sin3aQ60520 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sin3aQ60520 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sin3aQ60520 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sin3aQ60520 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sin3aQ60520 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sin3aQ60520 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sin3aQ60520 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sin3aQ60520 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sin3aQ60520 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sin3aQ60520 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sin3aQ60520 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sin3aQ60520 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sin3aQ60520 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sin3aQ60520 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sin3aQ60520 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sin3aQ60520 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sin3aQ60520 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sin3aQ60520 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sin3aQ60520 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sin3aQ60520 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Sin3aQ60520 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sin3aQ60520 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sin3aQ60520 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sin3aQ60520 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sin3aQ60520 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sin3aQ60520 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sin3aQ60520 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sin3aQ60520 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sin3aQ60520 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Sin3aQ60520 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sin3aQ60520 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sin3aQ60520 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sin3aQ60520 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sin3aQ60520 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sin3aQ60520 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Sin3aQ60520 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Sin3aQ60520 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sin3aQ60520 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms