Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV77

Ggnbp2, Gametogenetin-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 696 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggnbp2Q5SV77 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ggnbp2Q5SV77 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ggnbp2Q5SV77 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ggnbp2Q5SV77 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ggnbp2Q5SV77 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ggnbp2Q5SV77 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Ggnbp2Q5SV77 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Ggnbp2Q5SV77 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ggnbp2Q5SV77 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Ggnbp2Q5SV77 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ggnbp2Q5SV77 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ggnbp2Q5SV77 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ggnbp2Q5SV77 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ggnbp2Q5SV77 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ggnbp2Q5SV77 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ggnbp2Q5SV77 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ggnbp2Q5SV77 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ggnbp2Q5SV77 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ggnbp2Q5SV77 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ggnbp2Q5SV77 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ggnbp2Q5SV77 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ggnbp2Q5SV77 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ggnbp2Q5SV77 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ggnbp2Q5SV77 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ggnbp2Q5SV77 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ggnbp2Q5SV77 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ggnbp2Q5SV77 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ggnbp2Q5SV77 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ggnbp2Q5SV77 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ggnbp2Q5SV77 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ggnbp2Q5SV77 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ggnbp2Q5SV77 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ggnbp2Q5SV77 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ggnbp2Q5SV77 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ggnbp2Q5SV77 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ggnbp2Q5SV77 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ggnbp2Q5SV77 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ggnbp2Q5SV77 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Ggnbp2Q5SV77 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ggnbp2Q5SV77 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ggnbp2Q5SV77 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ggnbp2Q5SV77 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ggnbp2Q5SV77 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ggnbp2Q5SV77 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ggnbp2Q5SV77 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ggnbp2Q5SV77 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ggnbp2Q5SV77 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ggnbp2Q5SV77 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ggnbp2Q5SV77 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ggnbp2Q5SV77 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ggnbp2Q5SV77 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ggnbp2Q5SV77 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ggnbp2Q5SV77 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ggnbp2Q5SV77 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ggnbp2Q5SV77 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ggnbp2Q5SV77 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ggnbp2Q5SV77 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ggnbp2Q5SV77 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ggnbp2Q5SV77 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ggnbp2Q5SV77 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ggnbp2Q5SV77 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Ggnbp2Q5SV77 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Ggnbp2Q5SV77 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Ggnbp2Q5SV77 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ggnbp2Q5SV77 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Ggnbp2Q5SV77 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ggnbp2Q5SV77 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ggnbp2Q5SV77 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ggnbp2Q5SV77 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ggnbp2Q5SV77 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ggnbp2Q5SV77 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ggnbp2Q5SV77 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ggnbp2Q5SV77 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ggnbp2Q5SV77 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ggnbp2Q5SV77 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ggnbp2Q5SV77 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ggnbp2Q5SV77 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ggnbp2Q5SV77 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ggnbp2Q5SV77 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ggnbp2Q5SV77 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ggnbp2Q5SV77 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ggnbp2Q5SV77 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ggnbp2Q5SV77 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ggnbp2Q5SV77 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ggnbp2Q5SV77 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ggnbp2Q5SV77 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ggnbp2Q5SV77 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ggnbp2Q5SV77 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ggnbp2Q5SV77 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ggnbp2Q5SV77 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ggnbp2Q5SV77 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ggnbp2Q5SV77 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ggnbp2Q5SV77 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ggnbp2Q5SV77 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ggnbp2Q5SV77 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ggnbp2Q5SV77 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ggnbp2Q5SV77 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Ggnbp2Q5SV77 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ggnbp2Q5SV77 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ggnbp2Q5SV77 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms