Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sft2d1Q5SSN7 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sft2d1Q5SSN7 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sft2d1Q5SSN7 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sft2d1Q5SSN7 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sft2d1Q5SSN7 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sft2d1Q5SSN7 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sft2d1Q5SSN7 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sft2d1Q5SSN7 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Sft2d1Q5SSN7 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sft2d1Q5SSN7 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sft2d1Q5SSN7 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sft2d1Q5SSN7 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sft2d1Q5SSN7 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sft2d1Q5SSN7 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sft2d1Q5SSN7 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sft2d1Q5SSN7 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sft2d1Q5SSN7 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sft2d1Q5SSN7 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sft2d1Q5SSN7 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sft2d1Q5SSN7 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sft2d1Q5SSN7 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sft2d1Q5SSN7 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sft2d1Q5SSN7 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sft2d1Q5SSN7 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sft2d1Q5SSN7 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sft2d1Q5SSN7 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sft2d1Q5SSN7 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sft2d1Q5SSN7 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sft2d1Q5SSN7 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sft2d1Q5SSN7 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sft2d1Q5SSN7 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sft2d1Q5SSN7 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sft2d1Q5SSN7 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sft2d1Q5SSN7 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sft2d1Q5SSN7 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sft2d1Q5SSN7 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sft2d1Q5SSN7 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sft2d1Q5SSN7 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sft2d1Q5SSN7 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sft2d1Q5SSN7 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sft2d1Q5SSN7 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sft2d1Q5SSN7 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sft2d1Q5SSN7 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sft2d1Q5SSN7 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sft2d1Q5SSN7 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sft2d1Q5SSN7 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sft2d1Q5SSN7 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sft2d1Q5SSN7 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sft2d1Q5SSN7 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sft2d1Q5SSN7 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sft2d1Q5SSN7 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sft2d1Q5SSN7 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sft2d1Q5SSN7 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sft2d1Q5SSN7 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sft2d1Q5SSN7 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sft2d1Q5SSN7 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sft2d1Q5SSN7 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sft2d1Q5SSN7 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sft2d1Q5SSN7 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sft2d1Q5SSN7 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sft2d1Q5SSN7 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sft2d1Q5SSN7 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sft2d1Q5SSN7 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sft2d1Q5SSN7 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sft2d1Q5SSN7 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sft2d1Q5SSN7 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sft2d1Q5SSN7 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sft2d1Q5SSN7 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sft2d1Q5SSN7 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sft2d1Q5SSN7 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sft2d1Q5SSN7 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sft2d1Q5SSN7 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sft2d1Q5SSN7 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sft2d1Q5SSN7 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sft2d1Q5SSN7 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sft2d1Q5SSN7 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sft2d1Q5SSN7 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sft2d1Q5SSN7 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sft2d1Q5SSN7 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Sft2d1Q5SSN7 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sft2d1Q5SSN7 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sft2d1Q5SSN7 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sft2d1Q5SSN7 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sft2d1Q5SSN7 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sft2d1Q5SSN7 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Sft2d1Q5SSN7 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sft2d1Q5SSN7 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sft2d1Q5SSN7 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sft2d1Q5SSN7 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sft2d1Q5SSN7 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sft2d1Q5SSN7 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sft2d1Q5SSN7 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sft2d1Q5SSN7 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sft2d1Q5SSN7 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sft2d1Q5SSN7 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sft2d1Q5SSN7 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sft2d1Q5SSN7 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Sft2d1Q5SSN7 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Sft2d1Q5SSN7 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms