Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1A4

Trdv2-2, T cell receptor delta variable 2-2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trdv2-2Q5R1A4 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trdv2-2Q5R1A4 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trdv2-2Q5R1A4 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trdv2-2Q5R1A4 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trdv2-2Q5R1A4 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trdv2-2Q5R1A4 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trdv2-2Q5R1A4 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trdv2-2Q5R1A4 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trdv2-2Q5R1A4 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trdv2-2Q5R1A4 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trdv2-2Q5R1A4 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trdv2-2Q5R1A4 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trdv2-2Q5R1A4 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trdv2-2Q5R1A4 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trdv2-2Q5R1A4 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trdv2-2Q5R1A4 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trdv2-2Q5R1A4 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trdv2-2Q5R1A4 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trdv2-2Q5R1A4 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trdv2-2Q5R1A4 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trdv2-2Q5R1A4 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Trdv2-2Q5R1A4 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Trdv2-2Q5R1A4 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trdv2-2Q5R1A4 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trdv2-2Q5R1A4 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trdv2-2Q5R1A4 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trdv2-2Q5R1A4 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Trdv2-2Q5R1A4 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trdv2-2Q5R1A4 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trdv2-2Q5R1A4 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trdv2-2Q5R1A4 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trdv2-2Q5R1A4 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trdv2-2Q5R1A4 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trdv2-2Q5R1A4 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trdv2-2Q5R1A4 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trdv2-2Q5R1A4 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trdv2-2Q5R1A4 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trdv2-2Q5R1A4 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trdv2-2Q5R1A4 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trdv2-2Q5R1A4 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trdv2-2Q5R1A4 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trdv2-2Q5R1A4 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trdv2-2Q5R1A4 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trdv2-2Q5R1A4 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trdv2-2Q5R1A4 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trdv2-2Q5R1A4 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trdv2-2Q5R1A4 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trdv2-2Q5R1A4 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trdv2-2Q5R1A4 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trdv2-2Q5R1A4 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trdv2-2Q5R1A4 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trdv2-2Q5R1A4 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trdv2-2Q5R1A4 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Trdv2-2Q5R1A4 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trdv2-2Q5R1A4 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Trdv2-2Q5R1A4 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trdv2-2Q5R1A4 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Trdv2-2Q5R1A4 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trdv2-2Q5R1A4 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trdv2-2Q5R1A4 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trdv2-2Q5R1A4 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trdv2-2Q5R1A4 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trdv2-2Q5R1A4 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trdv2-2Q5R1A4 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trdv2-2Q5R1A4 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trdv2-2Q5R1A4 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trdv2-2Q5R1A4 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trdv2-2Q5R1A4 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trdv2-2Q5R1A4 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trdv2-2Q5R1A4 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trdv2-2Q5R1A4 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trdv2-2Q5R1A4 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trdv2-2Q5R1A4 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trdv2-2Q5R1A4 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trdv2-2Q5R1A4 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trdv2-2Q5R1A4 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trdv2-2Q5R1A4 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trdv2-2Q5R1A4 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trdv2-2Q5R1A4 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trdv2-2Q5R1A4 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trdv2-2Q5R1A4 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trdv2-2Q5R1A4 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trdv2-2Q5R1A4 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trdv2-2Q5R1A4 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trdv2-2Q5R1A4 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trdv2-2Q5R1A4 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trdv2-2Q5R1A4 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trdv2-2Q5R1A4 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trdv2-2Q5R1A4 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trdv2-2Q5R1A4 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trdv2-2Q5R1A4 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trdv2-2Q5R1A4 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trdv2-2Q5R1A4 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trdv2-2Q5R1A4 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trdv2-2Q5R1A4 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trdv2-2Q5R1A4 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trdv2-2Q5R1A4 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trdv2-2Q5R1A4 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trdv2-2Q5R1A4 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trdv2-2Q5R1A4 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms