Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1A3

Trdv4, T cell receptor delta variable 4 (Fragment), mousemouse

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trdv4Q5R1A3 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Trdv4Q5R1A3 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Trdv4Q5R1A3 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trdv4Q5R1A3 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Trdv4Q5R1A3 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trdv4Q5R1A3 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trdv4Q5R1A3 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trdv4Q5R1A3 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trdv4Q5R1A3 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trdv4Q5R1A3 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trdv4Q5R1A3 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trdv4Q5R1A3 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trdv4Q5R1A3 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trdv4Q5R1A3 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trdv4Q5R1A3 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trdv4Q5R1A3 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trdv4Q5R1A3 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trdv4Q5R1A3 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trdv4Q5R1A3 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trdv4Q5R1A3 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trdv4Q5R1A3 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Trdv4Q5R1A3 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trdv4Q5R1A3 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trdv4Q5R1A3 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trdv4Q5R1A3 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trdv4Q5R1A3 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Trdv4Q5R1A3 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Trdv4Q5R1A3 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Trdv4Q5R1A3 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trdv4Q5R1A3 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trdv4Q5R1A3 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trdv4Q5R1A3 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trdv4Q5R1A3 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trdv4Q5R1A3 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trdv4Q5R1A3 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trdv4Q5R1A3 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trdv4Q5R1A3 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trdv4Q5R1A3 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trdv4Q5R1A3 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trdv4Q5R1A3 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trdv4Q5R1A3 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trdv4Q5R1A3 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trdv4Q5R1A3 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trdv4Q5R1A3 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trdv4Q5R1A3 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trdv4Q5R1A3 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trdv4Q5R1A3 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trdv4Q5R1A3 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trdv4Q5R1A3 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trdv4Q5R1A3 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trdv4Q5R1A3 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trdv4Q5R1A3 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trdv4Q5R1A3 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Trdv4Q5R1A3 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trdv4Q5R1A3 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Trdv4Q5R1A3 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trdv4Q5R1A3 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Trdv4Q5R1A3 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trdv4Q5R1A3 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trdv4Q5R1A3 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trdv4Q5R1A3 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trdv4Q5R1A3 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Trdv4Q5R1A3 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Trdv4Q5R1A3 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trdv4Q5R1A3 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trdv4Q5R1A3 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trdv4Q5R1A3 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trdv4Q5R1A3 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Trdv4Q5R1A3 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trdv4Q5R1A3 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trdv4Q5R1A3 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trdv4Q5R1A3 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trdv4Q5R1A3 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trdv4Q5R1A3 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trdv4Q5R1A3 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trdv4Q5R1A3 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Trdv4Q5R1A3 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trdv4Q5R1A3 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trdv4Q5R1A3 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trdv4Q5R1A3 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trdv4Q5R1A3 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trdv4Q5R1A3 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trdv4Q5R1A3 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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