Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU56

Nlrc3, Protein NLRC3, mousemouse

Predictions only

Length 1,064 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc3Q5DU56 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nlrc3Q5DU56 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nlrc3Q5DU56 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nlrc3Q5DU56 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nlrc3Q5DU56 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nlrc3Q5DU56 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nlrc3Q5DU56 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nlrc3Q5DU56 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nlrc3Q5DU56 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nlrc3Q5DU56 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nlrc3Q5DU56 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nlrc3Q5DU56 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nlrc3Q5DU56 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nlrc3Q5DU56 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nlrc3Q5DU56 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Nlrc3Q5DU56 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nlrc3Q5DU56 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nlrc3Q5DU56 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nlrc3Q5DU56 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nlrc3Q5DU56 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nlrc3Q5DU56 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nlrc3Q5DU56 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nlrc3Q5DU56 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nlrc3Q5DU56 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nlrc3Q5DU56 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nlrc3Q5DU56 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nlrc3Q5DU56 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nlrc3Q5DU56 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Nlrc3Q5DU56 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nlrc3Q5DU56 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nlrc3Q5DU56 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nlrc3Q5DU56 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nlrc3Q5DU56 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nlrc3Q5DU56 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nlrc3Q5DU56 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nlrc3Q5DU56 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nlrc3Q5DU56 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Nlrc3Q5DU56 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nlrc3Q5DU56 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nlrc3Q5DU56 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nlrc3Q5DU56 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nlrc3Q5DU56 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nlrc3Q5DU56 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nlrc3Q5DU56 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nlrc3Q5DU56 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nlrc3Q5DU56 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nlrc3Q5DU56 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nlrc3Q5DU56 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Nlrc3Q5DU56 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nlrc3Q5DU56 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nlrc3Q5DU56 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nlrc3Q5DU56 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nlrc3Q5DU56 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nlrc3Q5DU56 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nlrc3Q5DU56 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nlrc3Q5DU56 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nlrc3Q5DU56 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nlrc3Q5DU56 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nlrc3Q5DU56 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nlrc3Q5DU56 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nlrc3Q5DU56 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nlrc3Q5DU56 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Nlrc3Q5DU56 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nlrc3Q5DU56 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nlrc3Q5DU56 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nlrc3Q5DU56 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nlrc3Q5DU56 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nlrc3Q5DU56 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nlrc3Q5DU56 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nlrc3Q5DU56 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nlrc3Q5DU56 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nlrc3Q5DU56 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nlrc3Q5DU56 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nlrc3Q5DU56 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nlrc3Q5DU56 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nlrc3Q5DU56 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nlrc3Q5DU56 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nlrc3Q5DU56 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Nlrc3Q5DU56 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nlrc3Q5DU56 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nlrc3Q5DU56 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nlrc3Q5DU56 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nlrc3Q5DU56 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nlrc3Q5DU56 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nlrc3Q5DU56 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nlrc3Q5DU56 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nlrc3Q5DU56 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nlrc3Q5DU56 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nlrc3Q5DU56 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nlrc3Q5DU56 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nlrc3Q5DU56 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nlrc3Q5DU56 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nlrc3Q5DU56 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nlrc3Q5DU56 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nlrc3Q5DU56 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nlrc3Q5DU56 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nlrc3Q5DU56 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nlrc3Q5DU56 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nlrc3Q5DU56 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nlrc3Q5DU56 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.1 ms