Protein–RNA interactions for Protein: Q52KR2

Lrig2, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,054 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrig2Q52KR2 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lrig2Q52KR2 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lrig2Q52KR2 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lrig2Q52KR2 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lrig2Q52KR2 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lrig2Q52KR2 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lrig2Q52KR2 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lrig2Q52KR2 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lrig2Q52KR2 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lrig2Q52KR2 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lrig2Q52KR2 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lrig2Q52KR2 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lrig2Q52KR2 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lrig2Q52KR2 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lrig2Q52KR2 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lrig2Q52KR2 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lrig2Q52KR2 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lrig2Q52KR2 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lrig2Q52KR2 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lrig2Q52KR2 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Lrig2Q52KR2 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lrig2Q52KR2 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lrig2Q52KR2 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lrig2Q52KR2 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lrig2Q52KR2 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lrig2Q52KR2 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lrig2Q52KR2 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lrig2Q52KR2 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lrig2Q52KR2 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lrig2Q52KR2 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lrig2Q52KR2 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lrig2Q52KR2 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lrig2Q52KR2 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lrig2Q52KR2 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lrig2Q52KR2 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lrig2Q52KR2 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lrig2Q52KR2 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lrig2Q52KR2 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lrig2Q52KR2 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lrig2Q52KR2 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lrig2Q52KR2 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lrig2Q52KR2 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lrig2Q52KR2 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lrig2Q52KR2 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lrig2Q52KR2 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lrig2Q52KR2 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lrig2Q52KR2 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lrig2Q52KR2 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lrig2Q52KR2 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lrig2Q52KR2 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lrig2Q52KR2 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lrig2Q52KR2 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lrig2Q52KR2 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lrig2Q52KR2 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lrig2Q52KR2 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lrig2Q52KR2 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lrig2Q52KR2 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lrig2Q52KR2 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lrig2Q52KR2 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lrig2Q52KR2 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lrig2Q52KR2 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lrig2Q52KR2 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lrig2Q52KR2 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lrig2Q52KR2 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lrig2Q52KR2 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lrig2Q52KR2 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lrig2Q52KR2 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Lrig2Q52KR2 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lrig2Q52KR2 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lrig2Q52KR2 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lrig2Q52KR2 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lrig2Q52KR2 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lrig2Q52KR2 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lrig2Q52KR2 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lrig2Q52KR2 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lrig2Q52KR2 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lrig2Q52KR2 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Lrig2Q52KR2 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Lrig2Q52KR2 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Lrig2Q52KR2 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Lrig2Q52KR2 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Lrig2Q52KR2 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Lrig2Q52KR2 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Lrig2Q52KR2 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Lrig2Q52KR2 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Lrig2Q52KR2 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Lrig2Q52KR2 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Lrig2Q52KR2 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Lrig2Q52KR2 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Lrig2Q52KR2 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Lrig2Q52KR2 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Lrig2Q52KR2 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Lrig2Q52KR2 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Lrig2Q52KR2 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Lrig2Q52KR2 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Lrig2Q52KR2 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Lrig2Q52KR2 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Lrig2Q52KR2 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Lrig2Q52KR2 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lrig2Q52KR2 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms