Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZJM7

Otol1, Otolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otol1Q4ZJM7 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Otol1Q4ZJM7 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Otol1Q4ZJM7 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Otol1Q4ZJM7 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Otol1Q4ZJM7 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Otol1Q4ZJM7 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Otol1Q4ZJM7 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Otol1Q4ZJM7 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Otol1Q4ZJM7 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Otol1Q4ZJM7 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Otol1Q4ZJM7 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Otol1Q4ZJM7 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Otol1Q4ZJM7 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Otol1Q4ZJM7 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Otol1Q4ZJM7 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Otol1Q4ZJM7 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Otol1Q4ZJM7 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Otol1Q4ZJM7 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Otol1Q4ZJM7 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Otol1Q4ZJM7 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Otol1Q4ZJM7 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Otol1Q4ZJM7 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Otol1Q4ZJM7 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Otol1Q4ZJM7 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Otol1Q4ZJM7 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Otol1Q4ZJM7 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Otol1Q4ZJM7 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Otol1Q4ZJM7 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Otol1Q4ZJM7 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Otol1Q4ZJM7 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Otol1Q4ZJM7 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Otol1Q4ZJM7 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Otol1Q4ZJM7 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Otol1Q4ZJM7 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Otol1Q4ZJM7 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Otol1Q4ZJM7 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Otol1Q4ZJM7 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Otol1Q4ZJM7 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Otol1Q4ZJM7 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Otol1Q4ZJM7 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Otol1Q4ZJM7 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Otol1Q4ZJM7 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Otol1Q4ZJM7 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Otol1Q4ZJM7 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Otol1Q4ZJM7 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Otol1Q4ZJM7 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Otol1Q4ZJM7 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Otol1Q4ZJM7 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Otol1Q4ZJM7 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Otol1Q4ZJM7 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Otol1Q4ZJM7 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Otol1Q4ZJM7 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Otol1Q4ZJM7 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Otol1Q4ZJM7 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Otol1Q4ZJM7 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Otol1Q4ZJM7 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Otol1Q4ZJM7 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Otol1Q4ZJM7 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Otol1Q4ZJM7 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Otol1Q4ZJM7 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Otol1Q4ZJM7 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Otol1Q4ZJM7 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Otol1Q4ZJM7 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Otol1Q4ZJM7 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Otol1Q4ZJM7 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Otol1Q4ZJM7 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Otol1Q4ZJM7 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Otol1Q4ZJM7 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Otol1Q4ZJM7 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Otol1Q4ZJM7 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Otol1Q4ZJM7 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Otol1Q4ZJM7 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Otol1Q4ZJM7 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Otol1Q4ZJM7 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Otol1Q4ZJM7 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Otol1Q4ZJM7 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Otol1Q4ZJM7 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Otol1Q4ZJM7 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Otol1Q4ZJM7 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Otol1Q4ZJM7 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Otol1Q4ZJM7 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Otol1Q4ZJM7 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Otol1Q4ZJM7 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Otol1Q4ZJM7 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Otol1Q4ZJM7 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Otol1Q4ZJM7 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Otol1Q4ZJM7 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Otol1Q4ZJM7 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Otol1Q4ZJM7 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Otol1Q4ZJM7 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Otol1Q4ZJM7 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Otol1Q4ZJM7 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Otol1Q4ZJM7 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Otol1Q4ZJM7 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Otol1Q4ZJM7 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Otol1Q4ZJM7 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Otol1Q4ZJM7 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Otol1Q4ZJM7 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Otol1Q4ZJM7 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Otol1Q4ZJM7 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms