Protein–RNA interactions for Protein: Q3V2J1

6430531B16Rik, RIKEN cDNA 6430531B16 gene, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
6430531B16RikQ3V2J1 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
6430531B16RikQ3V2J1 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
6430531B16RikQ3V2J1 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
6430531B16RikQ3V2J1 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
6430531B16RikQ3V2J1 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
6430531B16RikQ3V2J1 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
6430531B16RikQ3V2J1 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
6430531B16RikQ3V2J1 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
6430531B16RikQ3V2J1 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
6430531B16RikQ3V2J1 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
6430531B16RikQ3V2J1 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
6430531B16RikQ3V2J1 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
6430531B16RikQ3V2J1 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
6430531B16RikQ3V2J1 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
6430531B16RikQ3V2J1 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
6430531B16RikQ3V2J1 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
6430531B16RikQ3V2J1 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
6430531B16RikQ3V2J1 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
6430531B16RikQ3V2J1 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
6430531B16RikQ3V2J1 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
6430531B16RikQ3V2J1 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
6430531B16RikQ3V2J1 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
6430531B16RikQ3V2J1 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
6430531B16RikQ3V2J1 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
6430531B16RikQ3V2J1 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
6430531B16RikQ3V2J1 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
6430531B16RikQ3V2J1 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
6430531B16RikQ3V2J1 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
6430531B16RikQ3V2J1 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
6430531B16RikQ3V2J1 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
6430531B16RikQ3V2J1 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
6430531B16RikQ3V2J1 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
6430531B16RikQ3V2J1 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
6430531B16RikQ3V2J1 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
6430531B16RikQ3V2J1 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
6430531B16RikQ3V2J1 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
6430531B16RikQ3V2J1 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
6430531B16RikQ3V2J1 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
6430531B16RikQ3V2J1 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
6430531B16RikQ3V2J1 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
6430531B16RikQ3V2J1 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
6430531B16RikQ3V2J1 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
6430531B16RikQ3V2J1 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
6430531B16RikQ3V2J1 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
6430531B16RikQ3V2J1 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
6430531B16RikQ3V2J1 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
6430531B16RikQ3V2J1 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
6430531B16RikQ3V2J1 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
6430531B16RikQ3V2J1 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
6430531B16RikQ3V2J1 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
6430531B16RikQ3V2J1 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
6430531B16RikQ3V2J1 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
6430531B16RikQ3V2J1 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
6430531B16RikQ3V2J1 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
6430531B16RikQ3V2J1 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
6430531B16RikQ3V2J1 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
6430531B16RikQ3V2J1 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
6430531B16RikQ3V2J1 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
6430531B16RikQ3V2J1 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
6430531B16RikQ3V2J1 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
6430531B16RikQ3V2J1 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
6430531B16RikQ3V2J1 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
6430531B16RikQ3V2J1 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
6430531B16RikQ3V2J1 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
6430531B16RikQ3V2J1 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
6430531B16RikQ3V2J1 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
6430531B16RikQ3V2J1 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
6430531B16RikQ3V2J1 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
6430531B16RikQ3V2J1 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
6430531B16RikQ3V2J1 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
6430531B16RikQ3V2J1 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
6430531B16RikQ3V2J1 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
6430531B16RikQ3V2J1 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
6430531B16RikQ3V2J1 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
6430531B16RikQ3V2J1 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
6430531B16RikQ3V2J1 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
6430531B16RikQ3V2J1 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
6430531B16RikQ3V2J1 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
6430531B16RikQ3V2J1 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
6430531B16RikQ3V2J1 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
6430531B16RikQ3V2J1 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
6430531B16RikQ3V2J1 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
6430531B16RikQ3V2J1 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
6430531B16RikQ3V2J1 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
6430531B16RikQ3V2J1 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
6430531B16RikQ3V2J1 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
6430531B16RikQ3V2J1 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
6430531B16RikQ3V2J1 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
6430531B16RikQ3V2J1 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
6430531B16RikQ3V2J1 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
6430531B16RikQ3V2J1 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
6430531B16RikQ3V2J1 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
6430531B16RikQ3V2J1 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
6430531B16RikQ3V2J1 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
6430531B16RikQ3V2J1 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
6430531B16RikQ3V2J1 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
6430531B16RikQ3V2J1 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
6430531B16RikQ3V2J1 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
6430531B16RikQ3V2J1 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
6430531B16RikQ3V2J1 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms