Protein–RNA interactions for Protein: Q3V125

Ccdc110, Coiled-coil domain-containing protein 110, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc110Q3V125 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc110Q3V125 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc110Q3V125 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc110Q3V125 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc110Q3V125 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc110Q3V125 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc110Q3V125 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc110Q3V125 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Ccdc110Q3V125 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Ccdc110Q3V125 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc110Q3V125 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc110Q3V125 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc110Q3V125 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc110Q3V125 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc110Q3V125 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc110Q3V125 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc110Q3V125 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc110Q3V125 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc110Q3V125 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc110Q3V125 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc110Q3V125 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc110Q3V125 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc110Q3V125 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc110Q3V125 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc110Q3V125 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc110Q3V125 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc110Q3V125 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc110Q3V125 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc110Q3V125 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc110Q3V125 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc110Q3V125 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc110Q3V125 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc110Q3V125 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc110Q3V125 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc110Q3V125 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc110Q3V125 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc110Q3V125 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc110Q3V125 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc110Q3V125 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc110Q3V125 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc110Q3V125 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc110Q3V125 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc110Q3V125 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc110Q3V125 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc110Q3V125 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc110Q3V125 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc110Q3V125 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc110Q3V125 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc110Q3V125 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc110Q3V125 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc110Q3V125 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc110Q3V125 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc110Q3V125 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc110Q3V125 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc110Q3V125 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc110Q3V125 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc110Q3V125 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc110Q3V125 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc110Q3V125 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc110Q3V125 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc110Q3V125 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc110Q3V125 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc110Q3V125 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc110Q3V125 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc110Q3V125 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc110Q3V125 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc110Q3V125 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc110Q3V125 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc110Q3V125 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc110Q3V125 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc110Q3V125 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc110Q3V125 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc110Q3V125 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc110Q3V125 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc110Q3V125 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc110Q3V125 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc110Q3V125 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc110Q3V125 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc110Q3V125 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc110Q3V125 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc110Q3V125 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc110Q3V125 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc110Q3V125 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc110Q3V125 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc110Q3V125 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc110Q3V125 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc110Q3V125 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc110Q3V125 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc110Q3V125 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc110Q3V125 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc110Q3V125 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc110Q3V125 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc110Q3V125 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc110Q3V125 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc110Q3V125 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc110Q3V125 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc110Q3V125 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc110Q3V125 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc110Q3V125 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc110Q3V125 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms