Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0G7

Garnl3, GTPase-activating Rap/Ran-GAP domain-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,038 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Garnl3Q3V0G7 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Garnl3Q3V0G7 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Garnl3Q3V0G7 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Garnl3Q3V0G7 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Garnl3Q3V0G7 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Garnl3Q3V0G7 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Garnl3Q3V0G7 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Garnl3Q3V0G7 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Garnl3Q3V0G7 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Garnl3Q3V0G7 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Garnl3Q3V0G7 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Garnl3Q3V0G7 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Garnl3Q3V0G7 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Garnl3Q3V0G7 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Garnl3Q3V0G7 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Garnl3Q3V0G7 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Garnl3Q3V0G7 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Garnl3Q3V0G7 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Garnl3Q3V0G7 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Garnl3Q3V0G7 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Garnl3Q3V0G7 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Garnl3Q3V0G7 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Garnl3Q3V0G7 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Garnl3Q3V0G7 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Garnl3Q3V0G7 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Garnl3Q3V0G7 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Garnl3Q3V0G7 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Garnl3Q3V0G7 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Garnl3Q3V0G7 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Garnl3Q3V0G7 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Garnl3Q3V0G7 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Garnl3Q3V0G7 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Garnl3Q3V0G7 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Garnl3Q3V0G7 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Garnl3Q3V0G7 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Garnl3Q3V0G7 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Garnl3Q3V0G7 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Garnl3Q3V0G7 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Garnl3Q3V0G7 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Garnl3Q3V0G7 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Garnl3Q3V0G7 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Garnl3Q3V0G7 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Garnl3Q3V0G7 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Garnl3Q3V0G7 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Garnl3Q3V0G7 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Garnl3Q3V0G7 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Garnl3Q3V0G7 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Garnl3Q3V0G7 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Garnl3Q3V0G7 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Garnl3Q3V0G7 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Garnl3Q3V0G7 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Garnl3Q3V0G7 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Garnl3Q3V0G7 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Garnl3Q3V0G7 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Garnl3Q3V0G7 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Garnl3Q3V0G7 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Garnl3Q3V0G7 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Garnl3Q3V0G7 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Garnl3Q3V0G7 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Garnl3Q3V0G7 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Garnl3Q3V0G7 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Garnl3Q3V0G7 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Garnl3Q3V0G7 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Garnl3Q3V0G7 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Garnl3Q3V0G7 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Garnl3Q3V0G7 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Garnl3Q3V0G7 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Garnl3Q3V0G7 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Garnl3Q3V0G7 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Garnl3Q3V0G7 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Garnl3Q3V0G7 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Garnl3Q3V0G7 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Garnl3Q3V0G7 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Garnl3Q3V0G7 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Garnl3Q3V0G7 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Garnl3Q3V0G7 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Garnl3Q3V0G7 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Garnl3Q3V0G7 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Garnl3Q3V0G7 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Garnl3Q3V0G7 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Garnl3Q3V0G7 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Garnl3Q3V0G7 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Garnl3Q3V0G7 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Garnl3Q3V0G7 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Garnl3Q3V0G7 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Garnl3Q3V0G7 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Garnl3Q3V0G7 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Garnl3Q3V0G7 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Garnl3Q3V0G7 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Garnl3Q3V0G7 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Garnl3Q3V0G7 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Garnl3Q3V0G7 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Garnl3Q3V0G7 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Garnl3Q3V0G7 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Garnl3Q3V0G7 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Garnl3Q3V0G7 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Garnl3Q3V0G7 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Garnl3Q3V0G7 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Garnl3Q3V0G7 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Garnl3Q3V0G7 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms