Protein–RNA interactions for Protein: Q3V089

Rbm44, RNA-binding protein 44, mousemouse

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Length 1,013 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm44Q3V089 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rbm44Q3V089 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rbm44Q3V089 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rbm44Q3V089 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rbm44Q3V089 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rbm44Q3V089 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rbm44Q3V089 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rbm44Q3V089 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rbm44Q3V089 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rbm44Q3V089 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rbm44Q3V089 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rbm44Q3V089 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rbm44Q3V089 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rbm44Q3V089 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rbm44Q3V089 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rbm44Q3V089 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rbm44Q3V089 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rbm44Q3V089 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rbm44Q3V089 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rbm44Q3V089 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rbm44Q3V089 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rbm44Q3V089 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rbm44Q3V089 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Rbm44Q3V089 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rbm44Q3V089 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rbm44Q3V089 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rbm44Q3V089 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Rbm44Q3V089 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rbm44Q3V089 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rbm44Q3V089 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rbm44Q3V089 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rbm44Q3V089 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rbm44Q3V089 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rbm44Q3V089 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rbm44Q3V089 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rbm44Q3V089 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rbm44Q3V089 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rbm44Q3V089 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rbm44Q3V089 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Rbm44Q3V089 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rbm44Q3V089 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rbm44Q3V089 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rbm44Q3V089 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rbm44Q3V089 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rbm44Q3V089 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rbm44Q3V089 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rbm44Q3V089 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rbm44Q3V089 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rbm44Q3V089 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rbm44Q3V089 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rbm44Q3V089 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rbm44Q3V089 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rbm44Q3V089 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rbm44Q3V089 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rbm44Q3V089 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rbm44Q3V089 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Rbm44Q3V089 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rbm44Q3V089 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rbm44Q3V089 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rbm44Q3V089 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rbm44Q3V089 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rbm44Q3V089 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rbm44Q3V089 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rbm44Q3V089 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rbm44Q3V089 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rbm44Q3V089 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Rbm44Q3V089 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rbm44Q3V089 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rbm44Q3V089 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rbm44Q3V089 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rbm44Q3V089 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rbm44Q3V089 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Rbm44Q3V089 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rbm44Q3V089 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rbm44Q3V089 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rbm44Q3V089 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rbm44Q3V089 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rbm44Q3V089 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rbm44Q3V089 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rbm44Q3V089 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rbm44Q3V089 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Rbm44Q3V089 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rbm44Q3V089 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rbm44Q3V089 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rbm44Q3V089 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rbm44Q3V089 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rbm44Q3V089 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rbm44Q3V089 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rbm44Q3V089 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rbm44Q3V089 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rbm44Q3V089 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rbm44Q3V089 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rbm44Q3V089 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rbm44Q3V089 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rbm44Q3V089 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rbm44Q3V089 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rbm44Q3V089 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rbm44Q3V089 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rbm44Q3V089 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rbm44Q3V089 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
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